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[1]韩长志,刘艳,任雪敏.全基因组预测褐环乳牛肝菌的分泌蛋白[J].江苏农业科学,2017,45(23):45-48.
　Han Changzhi,et al.Total genome prediction of secreted proteins from Suillus luteus[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(23):45-48.
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全基因组预测褐环乳牛肝菌的分泌蛋白(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第45卷
期数:
2017年23期
页码:
45-48
栏目:
生物技术
出版日期:
2017-12-05

文章信息/Info

Title:
Total genome prediction of secreted proteins from Suillus luteus
作者:
韩长志; 刘艳; 任雪敏
西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室，云南昆明 650224
Author(s):
Han Changzhi; et al
关键词:
褐环乳牛肝菌; 全基因组; 分泌蛋白; 信号肽; 预测程序
Keywords:
-
分类号:
S182
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
褐环乳牛肝菌作为针叶树种上重要的外生真菌，为宿主植物提供营养元素和水分，在此过程中，对于该菌分泌蛋白发挥的作用机制尚不清楚。利用SignalP、ProtComp等预测程序对褐环乳牛肝菌中18 303条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻，明确其含有327个分泌蛋白，同时，对上述分泌蛋白的氨基酸大小分布、信号肽长度、信号肽切割位点等进行分析，明确该菌分泌蛋白的氨基酸长度集中于51~450 aa，信号肽长度以17~21 aa的序列最为集中，其信号肽切割位点均属于A-X-A类型。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了褐环乳牛肝菌分泌蛋白的预测，分泌蛋白的信号肽切割位点类型与其他已经报道的致病疫霉、粗糙脉孢霉、禾谷炭疽菌等分泌蛋白信号肽切割位点一致。研究结果为进一步解析分泌蛋白在该菌为宿主植物提供营养过程中发挥的作用机制提供重要的理论支持。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2016-06-29
基金项目：国家级大学生创新创业训练计划(编号：20160677004)；云南省高校优势特色重点学科(生态学)建设项目；真菌学国家重点实验室开放基金；云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队(编号：2014015)。
作者简介：韩长志(1981—)，男，河北石家庄人，博士，副教授，主要从事经济林木病害生物防治与真菌分子生物学的研究。E-mail：hanchangzhi2010@163.com。
更新日期/Last Update: 2017-12-05