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[1]王浩涵,杨洁清,欧阳小健,等.化州柚SCoT-PCR反应体系的优化及分类鉴别研究[J].江苏农业科学,2018,46(11):34-39.
　Wang Haohan,et al.Study on classification and identification of Citrus maxima cv. tomentosa and orthogonal optimization of its SCoT-PCR reaction system[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(11):34-39.
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化州柚SCoT-PCR反应体系的优化及分类鉴别研究(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第46卷
期数:
2018年第11期
页码:
34-39
栏目:
生物技术
出版日期:
2018-06-05

文章信息/Info

Title:
Study on classification and identification of Citrus maxima cv. tomentosa and orthogonal optimization of its SCoT-PCR reaction system
作者:
王浩涵;  杨洁清;  欧阳小健;  孙杨杨;  黄海波
广州中医药大学，广东广州 510006
Author(s):
Wang Haohan; et al
关键词:
化州柚; 化橘红; SCoT; 遗传多样性; 分类鉴别
Keywords:
-
分类号:
R284
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
用目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism，简称SCoT)分子标记对化州柚及其近缘种进行鉴别研究。为构建适合化州柚的SCoT-PCR最佳反应体系，对PCR体系的5大要素采用L25(56)表设计正交试验，得到最佳20 μL反应体系：3 mmol/L Mg2+、0.25 mmol/L dNTPs、0.75 U Taq酶、0.4 μmol/L引物、50 ng DNA。从36条引物中筛选出6条多态性明显的引物并优化其退火温度。最后用优化的6条引物对25份样品进行扩增，共扩增出94条条带，其中多态性条带69条，多态性比例范围55.56%~85.00%，平均多态性73.4%。构建的非加权配对算术平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means，简称UPGMA)聚类树能够较好地区分化州柚与其他柚类，且不同品种的化州柚间也存在一定的差异。因此在化州柚的分类鉴别研究中，SCoT标记不失为一种便捷、有效的手段。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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　Sun Yixin,et al.Analysis of difference of soil mineral elements in genuine producing area of Exocarpium citri Grandis[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(11):301.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2017-11-18
基金项目：国家中医药管理局公益性行业科研专项(编号：201407002-06)；全国第四次中药资源普查项目(编号：2017-152)；广东省岭南中药材保护专项(编号：2017-60)。
作者简介：王浩涵(1991—)，男，云南德宏人，硕士，主要从事中药鉴定及分子生物学研究。E-mail：410790512@qq.com。
通信作者：黄海波，副教授，主要从事中药鉴定与质量评价研究。E-mail：2865055919@qq.com。
更新日期/Last Update: 2018-06-05