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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第46卷

期数:

2018年第16期

页码:

25-30

栏目:

生物技术

出版日期:

2018-08-30

文章信息/Info

Title:

Relationship analysis between HDAC1 gene SNP assay and growth trait of Chinese Nanyang cattle

作者:

杨颖¹; 2;  陆江³;  李湘萍¹;  佘纳³;  唐核心³;  石德顺¹;  吕祁峰²;  徐照学⁴

1.广西大学动物科学技术学院，广西南宁 530004； 2.上海交通大学附属上海市第九人民医院，上海 200002；
3.湖北医药学院麻醉学研究所及附属太和医院麻醉科，湖北十堰 442000； 4.河南省畜牧研究所，河南郑州 476800

Author(s):

Yang Ying; et al

关键词:

南阳黄牛; HDAC1基因; 单核苷酸多态性; 生长性状

Keywords:

-

分类号:

S813.1；S823.8⁺12

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

采用DNA测序比对和PCR-SSCP分析技术，以15头南阳黄牛为样本，探讨HDAC1基因第5外显子、第11外显子、3′-UTR序列的单核苷酸多态性以及与南阳黄牛经济性状的关联性。结果显示，南阳黄牛HDAC1基因纯合子TT型频率比例最小，纯合子CC型频率比例最大；C等位基因占多数。南阳黄牛HDAC1基因第5外显子没有多态性位点；第11外显子在第110 bp处存在A/G突变位点，为同义突变。南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3′-UTR非翻译区存在2个突变：199 bp处的T/C多态性位点，其中TT型基因型频率＞TG型；以及49 bp处的A/C多态性位点，其中AA型基因型频率＞AC型。南阳黄牛HDAC1基因第11外显子基因多态性位点与其生长性状关联分析显示：AG和AA基因型群体中腰角宽、体长有显著性差异(P<0.05)，GG基因型比AG基因型群体在日增质量水平有显著提高(P<0.05)；在腰角宽、体长、日增质量上加性效应及显性效应水平显著(P<0.05)；其余性状均值在不同基因型群体中差异不显著。南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3′-UTR非翻译区T/C(199 bp)处位点多态性与生长性状关联性分析发现，各性状在不同基因型群体的均值均无显著差异；A/G(49 bp)处位点多态性与其生长性状关联分析表明：AC和AA基因型群体中在体高、尻长、十字部高和日增质量经济性状上差异显著(P<0.05)，体长性状二者差异极显著(P<0.01)。研究结果证实了南阳黄牛经济性状与其HDAC1基因片段中的一些SNP位点差异或多态性有关，这些SNP位点可以考虑为潜在的南阳黄牛分子育种目标位点。

Abstract:

-

参考文献/References:

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相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2017-02-22
基金项目：国家肉牛牦牛产业技术体系专项(编号：CARS-38)；国家教育部2016年度第二批国家级大学生创新创业训练计划项目(编号：201610929005)；国家教育部2012年度第二批国家级大学生创新创业训练计划项目(编号：201210929004)；湖北医药学院自然科学研究基金(编号：2011QDZR-2)；湖北省十堰市科学技术研究与开发项目(编号：14Y13)；湖北医药学院2015年学科建设资助项目(学科英才成长)；2017年度湖北医药学院附属太和医院科学研究基金。
作者介绍：杨颖(1983—)，女，河南商丘人，硕士，实验师，主要研究方向动物胚胎生物技术。E-mail：yangying_1983@126.com。
通信作者：徐照学，研究员，主要研究方向为胚胎生物工程，E-mail：xuzhaoxue11@163.com；陆江，博士，讲师，主要研究方向医学胚胎工程与干细胞，E-mail：lulujiangjiang@163.com。

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更新日期/Last Update: 2018-08-20