|本期目录/Table of Contents|

[1]臧胜芹,陈晓勇,杨凌,等.绵羊Cytb基因生物信息学分析[J].江苏农业科学,2018,46(18):24-27,37.
 Zang Shengqin,et al.Bioinformatics analysis of Cytb gene in sheep[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(18):24-27,37.
点击复制

绵羊Cytb基因生物信息学分析(PDF)
分享到:

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第46卷
期数:
2018年第18期
页码:
24-27,37
栏目:
生物技术
出版日期:
2018-09-20

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of Cytb gene in sheep
作者:
臧胜芹12 陈晓勇1 杨凌2 孙洪新1 敦伟涛1 梁瑞圆1
1.河北省畜牧兽医研究所,河北保定 071000; 2.河北工程大学生命科学与食品工程学院,河北邯郸 056038
Author(s):
Zang Shengqinet al
关键词:
Cytb基因绵羊蛋白质生物信息学
Keywords:
-
分类号:
S826.2
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为进一步了解和研究绵羊线粒体细胞色素b基因的结构和功能,采用生物信息学方法构建了不同物种的Cytb基因系统发育树,并对绵羊Cytb基因编码蛋白质理化性质、二级结构、亚细胞定位、蛋白质磷酸化、三级结构等进行分析。结果表明:绵羊和山羊亲缘关系最近,其次是家牛,与原鸡、斑马鱼亲缘关系较远。绵羊Cytb基因共编码379个氨基酸,以亮氨酸含量最高;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲占为主。综合分析,此蛋白质为酸性、不稳定性疏水性蛋白质,不存在信号肽,有9个跨膜结构域,主要在内质网、细胞核、线粒体内发挥其生物学作用。该蛋白质有较多的苏氨酸(Thr)、丝氨酸(Ser)磷酸化位点和相对较少的酪氨酸(Tyr)磷酸化位点。
Abstract:
-

参考文献/References:

[1]王备新,杨莲芳. 线粒体DNA序列特点与昆虫系统学研究[J]. 应用昆虫学报,2002,39(2):88-92.
[2]陈复生,付承玉,汪泰初. 动物线粒体基因分子系统学研究进展[J]. 安徽农业科学,2003,3(4):596-598.
[3]陈晓勇,敦伟涛,赵兴波. 哺乳动物线粒体基因组转录及其调控机制[J]. 中国草食动物科学,2013,33(2):53-58.
[4]Hatefi Y. The mitochondrial electron transport and oxidative phosphorylation system[J]. Annual Review of Biochemistry,1985,54(1):1015-1069.
[5]孙炳耘. 若干细胞色素b突变体蛋白的性质研究[D]. 上海:复旦大学,2000.
[6]陈晓勇. 绵羊产羔数性状线粒体基因效应研究[D]. 北京:中国农业大学,2014.
[7]Thompson J D,Gibson T J,Plewniak F,et al. The CLUSTAL_X windows interface:flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools[J]. Nucleic Acids Research,1998,25:4876-4882.
[8]Tamura K,Stecher G,Peterson D,et al. MEGA 6:Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0[J]. Molecular Biology and Evolution,2013,30(12):2725-2729.
[9]王菲露,宋杨. 基于广义回归神经网络的蛋白质二级结构预测[J]. 计算机仿真,2012,29(2):184-187.
[10]Irwin D M,Koeher T D,Wilson A C. Evolution of the Cytochrome b gene of mammals[J]. Journal of Molecular Evolution,1991,32(2):128-144.
[11]Schoepp B,Breton J,Parot P,et al. Relative orientation of the hemes of the cytochromebc1 complexes from Rhodobacter sphaeroides,Rhodospirillum rubrum,and beef heart mitochondria[J]. Journal of Biological Chemistry,2000,275(8):5284-5290.
[12]于永亮. 黑格尔七彩神仙鱼的线粒体基因组及与四种人工七彩神仙鱼Cytb、5S rDNA的比较分析[D]. 上海:上海海洋大学,2015.
[13]王克夷. 疏水作用和蛋白质[J]. 生命的化学,1999,19(5):233-235.
[14]Thorton J M. From genome to function[J]. Science,2001,292(5524):2095-2097.
[15]刘安芳,王继文,朱庆. 家鹅线粒体细胞色素b跨膜螺旋结构分析[J]. 畜牧兽医学报,2006,37(2):117-121.
[16]梁瑞圆,陈晓勇,孙少华,等. 绵羊TFAM基因编码蛋白生物信息学分析[J]. 基因组学与应用生物学,2017,36(2):575-581.

相似文献/References:

[1]古丽米热·阿布都热依木,吴阳升,林嘉鹏,等.绵羊卵丘细胞直径与卵母细胞质量的相关性[J].江苏农业科学,2014,42(12):236.
 Gulimire Abudureyimu,et al.Correlation between cumulus cell diameter and oocyte quality of sheep[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(18):236.
[2]宋德荣,彭华,周大荣,等.贵州半细毛羊血液生理生化指标分析[J].江苏农业科学,2014,42(10):189.
 Song Derong,et al.Analysis of blood physiological and biochemical indices of semi-wool sheep in Guizhou Province[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(18):189.
[3]张利,汪立芹,蒋香菊,等.不同直径卵泡对绵羊卵母细胞体外发育能力的影响[J].江苏农业科学,2014,42(03):141.
 Zhang Li,et al.Effects of follicles with different diameters on in vitro developmental capability of sheep oocytes[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(18):141.
[4]李基棕,李文良,毛立,等.1株绵羊溶血性曼氏杆菌的分离鉴定及致病性研究[J].江苏农业科学,2017,45(07):156.
 Li Jizong,et al.Isolation,identification and pathogenicity of a strain of Mannheimia haemolytica isolated from sheep[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(18):156.
[5]王世锋,米耶斯尔,詹建立,等.新疆地方绵羊ND2基因多态性及系统发育分析[J].江苏农业科学,2018,46(13):40.
 Wang Shifeng,et al.Genetic polymorphism and phylogenetic analysis of ND2 gene in local sheep in Xinjiang area[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(18):40.
[6]李大命,张彤晴,唐晟凯,等.基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的洪泽湖湖鲚遗传多样性分析[J].江苏农业科学,2018,46(20):36.
 Li Daming,et al.Study on genetic diversity of Coilia nasus population in Lake Hongze based on mtDNA Cytb gene and D-loop sequences[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(18):36.
[7]孔维欢,熊燊源,代蓉,等.TLR4基因在绵羊不同生理状态下子宫内膜组织中的mRNA表达[J].江苏农业科学,2019,47(01):35.
 Kong Weihuan,et al.mRNA expression of TLR4 gene in ovine endometrium under different physiological conditions[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(18):35.
[8]瞿静雯,王健,李拥军,等.绵羊卵母细胞成熟培养的研究进展[J].江苏农业科学,2019,47(10):22.
 Qu Jingwen,et al.Research progress of in vitro maturation of oocytes from sheep[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(18):22.
[9]彭小兵,杜吉革,彭国瑞,等.含腐败梭菌α毒素和产气荚膜梭菌ε毒素基因的重组大肠杆菌的高密度发酵和免疫效果[J].江苏农业科学,2019,47(17):186.
 Peng Xiaobing,et al.High-density fermentation and immune effect of recombinant Escherichia coli containing Clostridium putrificum α toxin and Clostridium perfringens ε toxin genes[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(18):186.
[10]陈来运,袁超,孙晓萍,等.4个绵羊品种FSHR基因多态性与生物信息学分析[J].江苏农业科学,2019,47(22):47.
 Chen Laiyun,et al.Polymorphism and bioinformatics analysis of FSHR gene in four sheep breeds[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(18):47.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2017-05-17
基金项目:河北省科技支撑计划(编号:15226308D);河北省重点研发计划(编号:18226624D);石家庄市科学技术研究与发展项目(编号:171501002A)。
作者简介:臧胜芹(1991—),女,河北邢台人,硕士,从事动物遗传育种与繁殖研究。E-mail:820712921@qq.com。
通信作者:陈晓勇,副研究员,从事动物遗传繁育及其生物技术研究。E-mail:chenxiaoyong-2000@163.com。
更新日期/Last Update: 2018-09-20