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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第47卷

期数:

2019年第08期

页码:

41-45

栏目:

生物技术

出版日期:

2019-05-19

文章信息/Info

Title:

Cloning and bioinformatics analysis of TLR4 gene in Wuzhishan pig from Hainan Province

作者:

黄丽丽¹; 2;  张艳¹; 2;  刘海隆¹;  林哲敏¹; 2;  谭树义¹; 2

1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所，海南海口 571100； 2.海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室，海南海口 571100

Author(s):

Huang Lili; et al

关键词:

五指山猪; TLR4基因; 克隆; 生物信息学分析

Keywords:

-

分类号:

S828.1；Q785

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

为获得海南五指山猪TLR4基因序列并分析其分子结构特征，以GenBank中猪的TLR4基因序列为参考序列，采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果显示，获得的五指山猪TLR4基因DNA序列长10 435 bp，其中编码区全长2 526 bp，共编码841个氨基酸；与GenBank中发布的普通猪的TLR4基因序列相比，存在38处突变(其中有2处突变位于编码区)；与普通猪、牛、绵羊、犬、马、猕猴、人、黑猩猩、小鼠和鸡的同源性分别为99.9%、80.7%、79.9%、74.8%、74.7%、73.1%、73%、72.7%、62.5%、43.4%；五指山猪TLR4编码的蛋白属于分泌性蛋白和跨膜蛋白，具有亲水性，有8个糖基化修饰位点、17个丝氨酸(ser)、7个苏氨酸(Thr)及8个酪氨酸(TYR)磷酸化位点；氨基酸系统进化树分析表明，不同物种TLR4基因在进化过程中具有较高的保守性。该结果为进一步深入研究TLR4基因的功能奠定基础。

Abstract:

-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2017-11-21
基金项目：国家自然科学基金(编号：31560696)；海南省农业科学院农业科技创新专项(编号：CXZX201504)；海南省自然科学基金(编号：20153080)。
作者简介：黄丽丽(1971—)，女，海南陵水人，畜牧师，研究方向为抗病育种。E-mail：17732440@qq.com。
通信作者：张艳，博士，副研究员，研究方向为动物疫病防治研究。E-mail：zy79818_0@163.com。

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更新日期/Last Update: 2019-04-20