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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第48卷

期数:

2020年第10期

页码:

85-93

栏目:

生物技术

出版日期:

2020-05-20

文章信息/Info

Title:

Bioinformatics and expression analysis of MADS gene family in Betula kirghisorum under NaHCO₃ salt stress

作者:

刘伟莹;  张雨晴;  王丹玉;  李佳妮;  杨成君

东北林业大学林学院，黑龙江哈尔滨 150040

Author(s):

Liu Weiying; et al

关键词:

吉尔吉斯白桦; MADS基因家族; MADS-box转录因子; 转录组文库; 非分泌性蛋白; 生物信息学; NaHNO₃胁迫; 基因表达

Keywords:

-

分类号:

Q943.2；R857.3；S792.153.01

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

为了探索MADS基因家族的耐盐胁迫功能，从以吉尔吉斯白桦(Betula kirghisorum)23号为试验材料测得的转录组文库中筛选出28个吉尔吉斯白桦的MADS-box基因序列对其编码蛋白的基本理化性质、亚细胞定位、二级结构、跨膜结构和信号肽、基因结构、保守基序、蛋白系统进化等方面进行初步生物信息学分析，并在NaHCO₃胁迫下对其表达情况进行分析。结果显示，除蛋白BkMADS1和BkMADS20外，其余均为亲水性蛋白；在28个吉尔吉斯白桦MADS蛋白中有19个定位在细胞核中；蛋白BkMADS7和BkMADS12的二级结构组成以无规则卷曲为主，其余蛋白则以α-螺旋为主；所有蛋白均没有信号肽，即全为非分泌性蛋白。此外，进化分析结果表明，MADS盒为MADS-box转录因子高度保守的结构域，大多数吉尔吉斯白桦MADS蛋白为Ⅱ型。在0.6% NaHCO₃胁迫下，15个BkMADS基因上调表达，13个BkMADS个基因下调表达。

Abstract:

-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2019-04-27
基金项目：东北林业大学大学生创新训练项目(编号：201810225478)。
作者简介：刘伟莹(1999—)，女，黑龙江巴彦人，主要从事森林植物资源学研究研究。E-mail：247335605@qq.com。
通信作者：杨成君，硕士，副教授，主要从事森林植物资源学研究。E-mail：nxyycj@sina.cn。

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更新日期/Last Update: 2020-05-20