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[1]邢冰,董诚明,魏硕,等.怀菊转录组中SSR位点信息分析[J].江苏农业科学,2020,48(11):57-60.
　Xing Bing,et al.Information analysis of SSR loci in transcriptome of Huai Chrysanthemi Flos[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2020,48(11):57-60.
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怀菊转录组中SSR位点信息分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第48卷
期数:
2020年第11期
页码:
57-60
栏目:
生物技术
出版日期:
2020-06-05

文章信息/Info

Title:
Information analysis of SSR loci in transcriptome of Huai Chrysanthemi Flos
作者:
邢冰1;  董诚明1; 2;  魏硕3;  李曼1;  李询1
1.河南中医药大学药学院，河南郑州 450046； 2.呼吸疾病河南省协同创新中心，河南郑州 450046；3. 四川大学，四川成都 610000
Author(s):
Xing Bing; et al
关键词:
怀菊; SSR; 位点信息; 转录组
Keywords:
-
分类号:
S567.23+9.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
以转录组测序数据为基础，利用MISA软件对简单重复序列(simple sequence repeat，简称SSR)进行检测及分析，分析怀菊转录组中的SSR位点信息，并设计SSR引物，为后期SSR标记的开发和物种遗传多样性检测等提供参考。结果表明，共检测到8 553个SSR位点，它们分布在 7 369 条Unigene中，出现频率为2.83%，SSR位点的发生频率为2.44%；其中单核苷酸重复基序最多、其次为三核苷酸重复基序。怀菊转录组基序长度主要集中于 12～19 bp，多具有中等多态性。对SSR序列设计引物，共得到25 662对引物可供今后使用。总之，怀菊SSR位点类型丰富，具有良好的多态性潜力及可开发性。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2019-09-20
基金项目：2016年度中央引导地方科技发展专项资金“河南道地大宗药材种质评价及集约化种植与示范”。
作者简介：邢冰(1995—)，女，河南郑州人，硕士研究生，主要从事药用植物研究。E-mail：xingbingywz@163.com。
通信作者：董诚明，教授，主要从事药用植物研究。E-mail：dcm371@hactcm.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2020-06-05