|本期目录/Table of Contents|

[1]韩丹,余文华,张蓉,等.贵州麻江分布小弧斑姬蛙的分子鉴定[J].江苏农业科学,2020,48(12):145-150.
　Han Dan,et al.Molecular identification of Microhyla heymonsi population distributed in Majiang，Guizhou Province[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2020,48(12):145-150.
点击复制

贵州麻江分布小弧斑姬蛙的分子鉴定(PDF)
分享到：

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第48卷
期数:
2020年第12期
页码:
145-150
栏目:
畜牧兽医与水产蚕桑
出版日期:
2020-06-20

文章信息/Info

Title:
Molecular identification of Microhyla heymonsi population distributed in Majiang，Guizhou Province
作者:
韩丹;  余文华;  张蓉;  李洪艳;  海艳;  张细林;  熊荣川
六盘水师范学院生物科学与技术学院，贵州六盘水 553004
Author(s):
Han Dan; et al
关键词:
小弧斑姬蛙; 16S rRNA基因; 克隆; 分子鉴定; 可疑序列
Keywords:
-
分类号:
S185
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
姬蛙是一大类常见的农田物种，通常个体较小，蝌蚪间差异不明显，难以准确鉴定。本研究对采自贵州省黔东南州麻江县姬蛙类蝌蚪标本进行DNA提取，使用PCR技术扩增线粒体16S rRNA基因片段，参照GenBank中同源序列的系统发育关系对其进行初步分子鉴定。结果表明，标本16S rRNA基因片段与27条小弧斑姬蛙(Microhyla heymonsi)同源序列聚为一个单系，该单系内部序列间遗传距离小于本研究所用参考序列的种间遗传距离，因此，初步鉴定标本为小弧斑姬蛙蝌蚪。同时，本研究中小弧斑姬蛙支系的序列间遗传距离略高于所有参考序列的种内遗传距离，并且在单倍型网络中被分割为6个独立网络，暗示分布广泛的小弧斑姬蛙种内存在较大的支系分化。另外，本研究对参考序列中的可疑序列进行了初步探讨。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］费梁，叶昌媛，江建平. 中国两栖动物及其分布彩色图鉴［M］. 成都：四川科学技术出版社，2012：568-569.
［2］Sheridan J A，Bickford D，Feng K，et al. An examination of call and genetic variation in three wide-ranging Southeast Asian anuran species［J］. The Raffles Bulletin of Zoology，2010，58(2)：369-379.
［3］费梁，胡淑琴，叶昌媛，等. 中国动物志两栖纲(中卷)无尾目［M］. 北京：科学出版社，2009：894-899.
［4］Matsui M，Ito H，Shimada T，et al. Taxonomic relationships within the pan-oriental narrow-mouth toad Microhyla ornata as revealed by mtDNA analysis(Amphibia，Anura，Microhylidae)［J］. Zoological Science，2005，22(4)：489-495.
［5］Matsui M. Taxonomic revision of one of the Old Worlds smallest frogs，with description of a new Bornean Microhyla(Amphibia，Microhylidae)［J］. Zootaxa，2011，2814(1)：33-49.
［6］Vences M. Phylogenetic studies on ranoid frogs(Amphibia：Anura)with a discussion of the origin and evolution of the vertebrate clades of Madagascar［D］. Bonn：University of Bonn，2000.
［7］Zhang P，Zhou H，Chen Y Q，et al. Mitogenomic perspectives on the origin and phylogeny of living amphibians［J］. Systematic Biology，2005，54(3)：391-400.
［8］Frost D R，Grant T，Faivovich J N，et al. The amphibian tree of life［J］. Bulletin of the American Museum of Natural History，2006，297：257-291.
［9］Rafael O S，Streicher J W，Sekonyela R，et al. Molecular phylogeny of microhylid frogs(Anura：Microhylidae)with emphasis on relationships among New World genera［J］. BMC Evolutionary Biology，2012，12(1)：1-21.
［10］Goutte S，Dubois A，Howard S D，et al. Environmental constraints and call evolution in torrent‐dwelling frogs［J］. Evolution，2016，70(4)：811-826.
［11］Mulcahy D G，Lee J L，Miller A H，et al. Filling the BINs of life：report of an amphibian and reptile survey of the Tanintharyi(Tenasserim)region of Myanmar，with DNA barcode data［J］. ZooKeys，2018(757)：85-152.
［12］Simon C，Frati F，Beckenbach A，et al. Evolution，weighting，and phylogenetic utility of mitochondrial gene sequences and a compilation of conserved polymerase chain reaction primers［J］. Annals of the Entomological Society of America，1994，87(6)：651-701.
［13］熊荣川，李明，田应洲，等. 贵州兴义华西雨蛙的分子鉴定［J］. 湖北农业科学，2015，54(19)：4865-4867.
［14］朱思瑾，张细林，张爽，等. 重庆酉阳分布寒露林蛙的分子鉴定［J］. 自然科学，2018，6(1)：1-8.
［15］Edgar R C. Muscle：multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput［J］. Nucleic Acids Research，2004，32(5)：1792-1797.
［16］Kumar S，Stecher G，Li M，et al. Mega X：molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms［J］. Molecular Biology and Evolution，2018，35(6)：1547-1549.
［17］Darriba D，Taboada G L，Doallo R，et al. jModelTest 2：more models，new heuristics and parallel computing［J］. Nature Methods，2012，9(8)：772.
［18］Silvestro D，Michalak I R. A graphical front-end for RAxML［J］. Organisms Diversity and Evolution，2012，12(4)：335-337.
［19］Ronquist F，Teslenko M，van der Mark P，et al. MrBayes 3.2：efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space［J］. Systematic Biology，2012，61(3)：539-542.
［20］熊荣川，田应洲，李松，等. 威宁中华蟾蜍的分子鉴定［J］. 贵州农业科学，2014，42(12)：32-36.
［21］Aktas C. Haplotypes：Manipulating DNA sequences and estimating unambiguous haplotype network with statistical parsimony［R］. Available from：https：//CRAN.R-project.org/package=haplotypes，2019.

相似文献/References:

[1]殷婷婷,薛梦颖,丁丽燕,等.嗜盐细菌XJ12的分子鉴定与生长特性研究[J].江苏农业科学,2013,41(11):368.
　Yin Tingting,et al.Study on molecular identification and growth characteristics of halobacteria XJ12[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(12):368.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2019-07-02
基金项目：六盘水师范学院院级大学生创新项目（编号：201610977003）；六盘水师范学院院级科技创新团队项目（编号：LPSSYKJTD201602）；贵州省教育厅基金项目（编号：黔教合KY字［2015］387号、黔教合人才团队字［2015］72号）；贵州省科技厅技术基金（编号：黔科合J字LKLS［2013］04号、黔科合J字LKLS［2013］06号）。
作者简介：韩丹(1996—)，女，贵州盘州人，硕士研究生，主要从事动物分子遗传多样性研究。 E-mail：1412694623@qq.com。
通信作者：熊荣川，博士，副教授，主要从事动物分子遗传多样性研究。E-mail：xiongrongchuan@126.com。
更新日期/Last Update: 2020-06-20