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[1]袁晓晴,彭凌,陈锦红,等.猪丹毒丝菌强毒株与弱毒疫苗株SpaA基因生物信息学分析[J].江苏农业科学,2020,48(17):70-76.
　Yuan Xiaoqing,et al.Bioinformatics analysis of SpaA gene in Erysipelothrix virulent strain and attenuated vaccine strain[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2020,48(17):70-76.
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猪丹毒丝菌强毒株与弱毒疫苗株SpaA基因生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第48卷
期数:
2020年第17期
页码:
70-76
栏目:
生物技术
出版日期:
2020-09-05

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of SpaA gene in Erysipelothrix virulent strain and attenuated vaccine strain
作者:
袁晓晴;  彭凌;  陈锦红;  温权;  刘博婷;  蔡巩林
韶关学院英东生命科学学院/粤北生猪生产及疫病防控协同创新发展中心，广东韶关 512005
Author(s):
Yuan Xiaoqing; et al
关键词:
猪丹毒丝菌; SpaA蛋白; 弱毒菌株; 生物信息学分析; B细胞抗原表位
Keywords:
-
分类号:
S852.61
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
对猪丹毒丝菌SpaA蛋白进行生物信息学分析，并对比了猪丹毒丝菌弱毒菌株和野生强毒菌株间的差异。结果显示，由于猪丹毒丝菌GC42的SpaA蛋白缺少一段含有80个氨基酸的序列，使得该菌株的蛋白质相对分子质量、氨基酸组成、二级和三级结构与强毒株的SpaA蛋白质相比均有所差异，导致这2株菌株引发机体产生的免疫原性和抗原性强弱有所不同，推测这2株菌株中，SG7菌株的免疫原性相对GC42较强；GC42菌株的抗原性相对SG7菌株的抗原性来说较弱，而猪丹毒丝菌GC42菌株的毒力相对猪丹毒丝菌SG7菌株较弱，因此呈现弱毒菌株特性；推测2株菌株的氨基酸序列均在193~206、217~231、290~309、313~327、328~376、386~457区段具有较高的形成B细胞表位的可能性。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］卢琴，李明波，彭先文，等. 猪丹毒杆菌SpaA基因的生物信息学分析［J］. 动物医学进展，2015，36(9)：23-27.
［2］曹文尧，李江伟，吕芳等. 丹毒丝菌SpaA基因免疫保护区的克隆与功能研究［J］. 中国预防兽医报，2007，29(7)：496-500.
［3］吾鲁木汗·那孜尔别克，张磊，何翠等. 猪丹毒丝菌天然SpaA和重组SpaA-N免疫保护效果的评价［J］. 微生物学报，2010，50(3)：367-372.
［4］林琳，江斌，吴胜会，等. 猪丹毒杆菌SpaA基因的克隆与生物信息学分析［J］. 中国兽医学报，2013，33(8)：1232-1236.
［5］冷非凡，罗文，李渊利，等. 嗜铁钩端螺旋菌中铁硫簇相关蛋白的生物信息学分析［J］. 基因组学与应用生物学，2018，37(12)：5296-5303.
［6］吾鲁木汗·那孜尔别克，刘祝祥，李科，等. 猪丹毒丝菌C43311株SpaA基因N端免疫保护区的克隆和表达［J］. 微生物学报，2008，48(2)：207-212.
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相似文献/References:

[1]朱伟峰,陈露,谭凯,等.猪丹毒丝菌GAPDH线性B细胞表位预测与鉴定[J].江苏农业科学,2021,49(22):171.
　Zhu Weifeng,et al.Prediction and identification of GAPDH linear B cell epitopes of Erysipelothrix rhusiopathiae[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(17):171.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2019-11-17
基金项目：广东省自然科学基金(编号：2017A030307041)；广东省科技创新战略专项资金——“攀登计划”专项资金(编号：pdjh2020b0537)。
作者简介：袁晓晴(1999—)，女，广东罗定人，主要从事分子生物学方面的研究。E-mail：1042432568@qq.com。
通信作者：彭凌，硕士，副教授，主要从事动物病原微生物及分子生物学方面的研究。E-mail：penglingfx@sgu.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2020-09-05