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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第48卷

期数:

2020年第24期

页码:

178-182

栏目:

畜牧兽医与水产蚕桑

出版日期:

2020-12-30

文章信息/Info

Title:

Analysis of jejunum microbial diversity of Muchuan black bone chicken by Illumina MiSeq sequencing platform

作者:

廖娟;  王钢;  喻世刚;  梁梓

乐山师范学院/川南地方品种鸡产业化四川省高等学校工程研究中心，四川乐山 614000

Author(s):

Liao Juan; et al

关键词:

沐川乌骨黑鸡; Illumina MiSeq测序; 空肠; 微生物; 多样性

Keywords:

-

分类号:

S831；S182

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

为探索沐川乌骨鸡肠道微生物多样性，采用Illumina MiSeq测序平台对10羽沐川乌骨鸡的空肠内容物样本中微生物的16S rDNA-V4变异区进行测序，利用UPARSE等软件分析和统计样品中的操作分类单元(OTUs)数量，并进行物种注释及丰度分析，揭示样品的物种构成。结果表明，共获得667 466条tags，在97%相似水平上进行OTU分类，被归类于3 154个OTUs，且由稀释曲线可知此次测序结果较全面地覆盖了沐川乌骨黑鸡空肠微生物群落。门水平上，占优势的门主要有厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)，但这3种优势菌门在不同样品中所占比例均有所差异。在属水平上，在10个样品中所占比例均大于1%的菌属有乳杆菌属(Lactobacillus)和Romboutsia菌属。

Abstract:

-

参考文献/References:

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相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2020-04-26
资助项目：乐山师范学院重点实验室平台项目(编号：2019LSPZJ001)。
作者简介：廖娟(1990—)，女，四川乐山人，硕士，实验师，主要从事肠道微生物多样性研究。E-mail：lsliaojuan@163.com。
通信作者：王钢(1979—)，男，重庆人，硕士，教授，主要从事养殖业废弃物处理与资源化利用研究。

常用功能

更新日期/Last Update: 2020-12-20