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[1]王仁汉,宋志美,屈旭,等.普通烟草YUCCA基因家族的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2021,49(3):61-65.
　Wang Renhan,et al.Bioinformatics analysis of YUCCA gene family in common tobacco (Nicotiana tabacum L.)[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(3):61-65.
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普通烟草YUCCA基因家族的生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第49卷
期数:
2021年第3期
页码:
61-65
栏目:
生物技术
出版日期:
2021-02-05

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of YUCCA gene family in common tobacco (Nicotiana tabacum L.)
作者:
王仁汉1; 宋志美1; 2; 屈旭1; 刘少云1; 2; 李毅君1; 2
1.青岛中烟种子有限责任公司，山东青岛 266000； 2.中国农业科学院烟草研究所，山东青岛 266000
Author(s):
Wang Renhan; et al
关键词:
烟草; YUCCA基因家族; 生物信息学; 生长素
Keywords:
-
分类号:
Q344+.14；S188
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
YUC基因家族催化吲哚-3-丙酮酸(IPA)生成生长素(IAA)的过程，进而调控植物生长素的合成。目前，研究者已经在多种植物上鉴定分析了YUCCA基因家族，但是关于烟草中该基因的报道较少。为了探讨普通烟草YUCCA基因结构及功能，通过检索普通烟草全基因组蛋白序列，筛选出21个烟草YUCCA基因家族序列，利用生物信息学工具对其蛋白质结构域、亚细胞定位、同源性进行分析。系统发育树分析结果显示，烟草YUCCA蛋白可以聚类到4个分支，与同为单子叶植物的拟南芥的亲缘关系较近。结构域分析结果显示，烟草YUCCA基因内含子数量在0～6个之间；协同进化树分析结果显示，亲缘关系近的基因内含子数量较为相近；亚细胞定位结果显示，19个序列定位到细胞质，2个序列定位到细胞质膜，该基因可能参与细胞质基因的转录调控。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2020-06-28
基金项目：青岛中烟种子有限责任公司科研专项。
作者简介：王仁汉(1989—)，男，山东青岛人，硕士，主要从事作物分子遗传育种方面的研究。E-mail：wrhqd@qq.com。
通信作者：李毅君，研究员，主要从事烟草育种方面的工作。E-mail：liyijun@caas.cn。
更新日期/Last Update: 2021-02-05