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[1]朱畇昊,彭淑萍,赵乐,等.地黄促生内生尖孢镰刀菌GG22基因组结构分析[J].江苏农业科学,2021,49(19):72-77.
　Zhu Yunhao,et al.Genomic structure analysis of plant growth-promoting endophytic Fusarium oxysporum GG22 in Rehmannia glutinosa[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(19):72-77.
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地黄促生内生尖孢镰刀菌GG22基因组结构分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第49卷
期数:
2021年第19期
页码:
72-77
栏目:
生物技术
出版日期:
2021-10-05

文章信息/Info

Title:
Genomic structure analysis of plant growth-promoting endophytic Fusarium oxysporum GG22 in Rehmannia glutinosa
作者:
朱畇昊1; 2; 彭淑萍1; 赵乐1; 2; 董诚明1; 2
1.河南中医药大学药学院，河南郑州 450046；2. 呼吸疾病中医药防治省部共建协同创新中心，河南郑州 450046
Author(s):
Zhu Yunhao; et al
关键词:
地黄; 内生真菌; 尖孢镰刀菌; 基因组; 次生代谢
Keywords:
-
分类号:
S567.23+9.01；S182
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
通过高通量测序分析1株能够促进地黄生长及次生代谢产物积累的内生尖孢镰刀菌的基因组结构，推测其内生及促生机制。使用Illumina Hiseq X ten双端测序技术对内生真菌GG22进行基因组测序，并进行生物信息学分析。分析结果，共得到17 296个预测的基因，其中基因的总长度26 937 813 bp，平均基因长度为1 557.4 bp。与KOG、KEGG、Swiss-Prot、TrEMBL、Nr及Pfam常用功能数据库进行BLAST比对，共有17 202个基因得到功能注释，注释率为99.46%，其中有3 801个基因注释到KEGG数据库中；7 431个基因注释到KOG数据库中；11 548个基因注释到 Pfam 数据库中；9 007个基因注释到 Swissprot数据库中；17 201个基因注释到TrEMBL数据库中，且分别有881、5 247、158个基因被注释到CAZyme、PHI、TCDB数据库。基因功能分类分析发现，尖孢镰刀菌GG22的细胞运动和细胞外结构不发达，这可能是其成为地黄块根寄生内生菌的原因之一。基因簇分析得出，GG22可能能够产生碧卡维林等化合物而抑制其他微生物的生长，同时保护寄主植物免受其他病原菌的侵害，成为地黄促生内生真菌。通过对GG22基因组结构进行分析，初步获得了其内生性生物学基础，为进一步阐明其促进地黄生长及次生代谢产物积累奠定了基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2021-03-16。
基金项目：国家自然科学基金（编号：81603232）；国家重点研发计划（编号：2017YFC1702800）；河南省科技攻关计划（编号：172102310539）。
作者简介：朱畇昊（1986—），男，河南郑州人，博士，副教授，主要从事药用植物分子生物学研究。 E-mail：guxinhan123@163.com。
通信作者：董诚明，教授，主要从事中药材规范化种植研究。E-mail：dcm371@sohu.com。
更新日期/Last Update: 2021-10-05