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[1]陈燕,郭聪,王莹,等.杜梨叶片转录组分析[J].江苏农业科学,2022,50(3):58-67.
　Chen Yan,et al.Transcriptome analysis of Pyrus betulifolia Bunge leaves[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(3):58-67.
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杜梨叶片转录组分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第50卷
期数:
2022年第3期
页码:
58-67
栏目:
“转录组”专题
出版日期:
2022-02-05

文章信息/Info

Title:
Transcriptome analysis of Pyrus betulifolia Bunge leaves
作者:
陈燕;  郭聪;  王莹;  李玉娟
江苏沿江地区农业科学研究所，江苏南通 226541
Author(s):
Chen Yan; et al
关键词:
杜梨; 叶色; 转录组测序; 功能注释; 单核苷酸多态性
Keywords:
-
分类号:
S687.901
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)抗逆性强，叶色随季节变化而改变，被广泛用于沿海滩涂景观改造，是园林绿化中常用树种。为了解杜梨色叶相关基因调控途径，对杜梨叶片进行转录组测序，共获得67.7 Gb测序数据，通过组装共得到60 611个基因，其中包含1 059个新基因；与8个功能数据库进行比对分析，共57 669个基因得到了功能注释，注释效率为95.15%；GO分析发现，已注释的差异表达基因共涉及49个功能组，主要集中在膜(细胞组分)、催化活性(分子功能)、代谢过程(生物学过程)等中；KEGG分析发现，差异表达基因主要富集在碳代谢和植物-病原体相互作用等生物学过程中；共筛选出10个与类黄酮相关的基因，分别属于UDPGT等6个基因家族；在杜梨叶片转录组中共筛选出452 501个SNP位点，碱基转换类型所占比例远远高于颠换类型，表明杜梨具有丰富的SNP位点信息。本研究结果可为探究杜梨色叶分子机制等提供理论依据。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2021-11-03
基金项目：江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划［编号：ZX(21)1231］；江苏省南通市基础科学研究计划(编号：CJ2019046)。
作者简介：陈燕(1993—)，女，江苏扬州人，研究实习员，主要从事彩叶植物应用和休闲农业研究。E-mail：517079542@qq.com。
通信作者：李玉娟，副研究员，主要从事彩叶植物栽培应用等研究。E-mail：381260896@qq.com。
更新日期/Last Update: 2022-02-05