|本期目录/Table of Contents|

[1]宋兴超,赵园园,孟金柱,等.山羊原癌基因c-fos电子克隆与生物信息学分析[J].江苏农业科学,2022,50(3):68-73.
 Song Xingchao,et al.In silico cloning and bioinformatics analysis of Capra hircus c-fos gene[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(3):68-73.
点击复制

山羊原癌基因c-fos电子克隆与生物信息学分析(PDF)
分享到:

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第50卷
期数:
2022年第3期
页码:
68-73
栏目:
生物技术
出版日期:
2022-02-05

文章信息/Info

Title:
In silico cloning and bioinformatics analysis of Capra hircus c-fos gene
作者:
宋兴超 赵园园 孟金柱 吴震洋 安清明
铜仁学院农林工程与规划学院/贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室,贵州铜仁 554300
Author(s):
Song Xingchaoet al
关键词:
原癌基因山羊染色体生物信息学分析肌肉发育
Keywords:
-
分类号:
S827
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为探明山羊原癌基因c-fos的结构与功能,以牛c-fos基因编码序列(GenBank登录号为AY322482)作为种子序列电子克隆了山羊c-fos基因cDNA序列,并利用生物信息学方法对其完整编码序列的蛋白理化特征、二级结构、亲/疏水性进行全面解析,进一步预测了该基因在山羊染色体上的定位。结果表明,山羊c-fos基因cDNA全长 1 513 bp,开放阅读框为1 143 bp,共编码380个氨基酸,G+C含量高于A+T;山羊c-fos基因编码蛋白二级结构主要以无规则卷曲为主,其他为α-螺旋,延伸直链较少,属于一种亲水性、酸性不稳定蛋白;山羊与同属反刍动物的绵羊、牛和马鹿c-fos基因核苷酸序列相似性为95.4%~99.5%;c-fos基因可能定位于山羊10号染色体上。山羊c-fos基因电子克隆及序列分析为解析其调控肌肉发育的生理功能提供了详尽的生物学基础信息。
Abstract:
-

参考文献/References:

[1]Finkel M P,Biskis B O,Jinkins P B. Virus induction of osteosarcomas in mice[J]. Science,1966,151(3711):698-701.
[2]宋丽霞,刘淑英. 不同光照下褪黑素变化对鸡骨髓内c-fos原癌基因表达的影响[J]. 中国畜牧兽医,2009,36(9):186-189.
[3]崔家杰,谢强,翟双双,等. 光照度对樱桃谷肉鸭c-fos、生物钟基因表达及褪黑激素的影响[J]. 中国农业科学,2020,53(4):848-856.
[4]Ma J T,Ng S Y.Muscle homeodomain protein MHox inhibits ternary complex formation at the c-fos serum response element[J]. Biochemical and Biophysical Research Communications,1994,200(3):1742-1747.
[5]Trouche D,Masutani H,Groisman R,et al. Myogenin binds to and represses c-fos promoter[J]. FEBS Letters,1995,361(2/3):140-144.
[6]Lee K,Buhr J,Hausman G J,et al. Expression of c-fos in subcutaneous adipose tissue of the fetal pig[J]. Molecular and Cellular Biochemistry,1996,155(1):31-35.
[7]郭云雁,程笃学,张龙超,等. MyoGc-fos基因多态性及其合并基因型与猪肌纤维性状的关联分析[J]. 畜牧兽医学报,2013,44(2):188-196.
[8]Reiner G,Heinricy L,Müller E,et al. Indications of associations of the porcine FOS proto-oncogene with skeletal muscle fibre traits[J]. Animal Genetics,2002,33(1):49-55.
[9]Francis S M,Suttie J M.Detection of growth factors and proto-oncogene mRNA in the growing tip of red deer (Cervus elaphus) antler using reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR)[J]. The Journal of Experimental Zoology,1998,281(1):36-42.
[10]韩春梅,李世军,唐继伟,等. 原癌基因c-fos在塔里木马鹿茸组织中表达特性的研究[J]. 畜牧兽医学报,2012,43(2):226-231.
[11]Grzegorski S J,Chiari E F,Robbins A,et al. Natural variability of Kozak sequences correlates with function in a zebrafish model[J]. PLoS One,2014,9(9):e108475.
[12]武延风.塔里木马鹿c-fos cDNA克隆、SNP及与茸重的关联分析[D]. 阿拉尔:塔里木大学,2012.
[13]雷初朝,李瑞彪,陈宏,等. 山羊与绵羊的染色体核型比较[J]. 西北农业学报,2001,10(3):12-15.
[14]沈祖楠,李祥龙,周荣艳,等. 牛、绵羊和山羊染色体同源性分析及山羊部分毛色候选基因染色体电子定位[J]. 畜牧兽医学报,2009,40(9):1308-1314.
[15]孙淼,赵茂林. 利用表达序列标签电子克隆cDNA全序列的策略[J]. 生物技术通报,2010(1):49-52.
[16]杜尚广,余波. 木薯MeZnT11基因的电子克隆与生物信息学分析[J]. 植物生理学报,2020,56(5):1088-1095.
[17]马小娅,庞春英,梁莎莎,等. 水牛FADS2基因的电子克隆及序列分析[J]. 中国畜牧兽医,2017,44(10):2829-2836.
[18]胡波,魏后军,范志宇,等. 新西兰兔Nrf2基因的克隆、序列分析及组织表达[J]. 中国兽医学报,2020,40(5):1053-1058.
[19]何志颖,姚玉成.EST技术及其在基因全长cDNA克隆上的应用策略[J]. 国外医学.遗传学分册,2002,25(2):67-69.
[20]Shi L J,Mao C P,Zeng F X,et al. Central cholinergic mechanisms mediate swallowing,renal excretion,and c-fos expression in the ovine fetus near term[J]. American Journal of Physiology.Regulatory,Integrative and Comparative Physiology,2009,296(2):318-325.
[21]Fujiwara K T,Ashida K,Nishina H,et al. The chicken c-fos gene:Cloning and nucleotide sequence analysis[J]. Journal of Virology,1987,61(12):4012-4018.

相似文献/References:

[1]胡新岗,黄银云.1例引入性波尔杂交羊传染性胸膜肺炎的诊治[J].江苏农业科学,2013,41(04):189.
[2]卢炜,张磊,刘静,等.口服半胱胺对肉羊生产性能和血清激素水平的影响[J].江苏农业科学,2014,42(11):241.
 Lu Wei,et al().Effects of oral cysteamine on production performance and serum hormone levels of mutton sheep[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(3):241.
[3]宋德荣,王嘉福,周大荣,等.贵州黑马羊新品种培育[J].江苏农业科学,2013,41(06):163.
 Song Derong,et al.Breeding of new Guizhou dark horse sheep variety[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(3):163.
[4]劳雪芬,曹铮,汤里平,等.富硒女贞子对山羊生产性能、血液学和血清生化指标的影响[J].江苏农业科学,2016,44(03):256.
 Lao Xuefen,et al.Effects of Se-enriched Ligustrum lucidum fruits on performance,hematology and serum biochemical indices of goats[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(3):256.
[5]骆美蓉,江明锋,张鹏,等.山羊分子生物学研究进展[J].江苏农业科学,2014,42(01):46.
 Luo Meirong,et al.Research progress of molecular biology of goat[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(3):46.
[6]于鸿浩,闫海龙,朱海鲸,等.山羊卵泡数量对卵母细胞体外成熟的影响[J].江苏农业科学,2015,43(09):232.
 Yu Honghao,et al.Effect of follicle number on oocyte in vitro mature of goat[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(3):232.
[7]胡新岗,黄银云,徐婷婷,等.江苏泰州地区山羊传染性胸膜肺炎血清学调查[J].江苏农业科学,2015,43(07):228.
 Hu Xingang,et al.Serological survey of contagious caprine pleuropneumonia in Taizhou,Jiangsu Province[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(3):228.
[8]卢劲晔,刘静,卢炜,等.日粮能量水平对山羊瘤胃上皮细胞周期的影响[J].江苏农业科学,2014,42(06):145.
 Lu Jingye,et al.Effect of dietary energy on rumen epithelium cell cycle of goats[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(3):145.
[9]杨家大.山羊心脏型脂肪酸结合蛋白基因mRNA的组织表达谱分析[J].江苏农业科学,2015,43(06):24.
 Yang Jiada.Analysis of tissue expression profiles of H-FABP gene in goats[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(3):24.
[10]白云峰,高立鹏,涂远璐,等.精饲料水平对育肥山羊玉米苞叶自由采食量及生产性能的影响[J].江苏农业科学,2015,43(05):201.
 Bai Yunfeng,et al.Effect of concentrated feed levels on free intake and production performance of meat goats fed corn bract feed[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(3):201.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2021-04-27
基金项目:贵州省铜仁市科学技术局博士人才项目[编号:铜市科研(2020)126号];铜仁学院博士科研启动基金(编号:trxyDH2001);贵州省科技计划(编号:黔科合支撑2020-1Y029);贵州省普通高等学校科技拔尖人才支持计划(编号:黔教合KY字2017-089);贵州省铜仁市科技计划(编号:2020-75)
作者简介:宋兴超(1982—),男,河北博野人,博士,副教授,主要从事特种畜禽遗传育种研究。E-mail:songxingchao_888@126.com。
通信作者:安清明,博士,教授,主要从事山羊遗传育种研究。E-mail:anqingming2009@163.com。
更新日期/Last Update: 2022-02-05