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[1]陈光建,覃悦,韩长志.希金斯炭疽菌中NPFxD基序蛋白找寻及其生物信息学分析[J].江苏农业科学,2022,50(5):35-40.
　Chen Guangjian,et al.Search for NPFxD motif protein in Colletotrichum higginsanum and its bioinformatics analysis[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(5):35-40.
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希金斯炭疽菌中NPFxD基序蛋白找寻及其生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第50卷
期数:
2022年第5期
页码:
35-40
栏目:
生物技术
出版日期:
2022-03-05

文章信息/Info

Title:
Search for NPFxD motif protein in Colletotrichum higginsanum and its bioinformatics analysis
作者:
陈光建1; 2;  覃悦1; 2;  韩长志1; 3
1.西南林业大学生物多样性保护学院，云南昆明 650224； 2.西南林业大学研究生院，云南昆明 650224；3.云南省森林灾害预警与控制重点实验室，云南昆明 650224
Author(s):
Chen Guangjian; et al
关键词:
胞吞作用; 希金斯炭疽菌; NPFxD基序蛋白; 生物信息学
Keywords:
-
分类号:
S436.3；S432.4+4
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
希金斯炭疽菌是一种半活体营养型植物炭疽病原真菌，能够侵染多种十字花科植物引起的炭疽病，特别是引起蔬菜炭疽病的重要病原。胞吞在真菌侵染植物过程中发挥着重要作用，该作用一般同具有NPFxD基序的蛋白受体介导有关，然而，目前有关该炭疽菌中胞吞作用相关蛋白尚未明确。基于前人已报道的构巢曲霉中NPFxD蛋白序列，通过关键词搜索以及Blastp比对等方法对希金斯炭疽菌蛋白质数据库进行NPFxD蛋白找寻，明确该菌中存在2个NPFxD蛋白序列，根据蛋白同源性，分别命名为ChMYO1、ChGBP2。同时，对这2个蛋白序列开展了保守结构域及跨膜区结构、蛋白质理化性、信号肽、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析。结果表明，ChMYO1、ChGBP2蛋白亚细胞定位情况不同，前者定位在质膜，后者定位在核内；两者在亲疏水性、最高氨基酸残基和其位置等均有着一定差异；两者均无明显的信号肽序列；两者均含有无规则卷曲、α螺旋、β卷曲，而缺乏TM螺旋。此外，对多个不同真菌中NPFxD基序同源蛋白序列开展遗传关系分析，明确希金斯炭疽菌中的NPFxD基序蛋白与炭疽菌属中其他病菌中的蛋白具有较高的同源性，本研究为进一步研究炭疽菌属NPFxD基序蛋白的功能提供了理论参考。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2021-06-08
基金项目：云南省“兴滇英才支持计划”青年人才专项(编号：YNWR-QNBJ-2020-188)；国家自然科学基金(编号：31960211)。
作者简介：陈光建(1987—)，男，云南大理人，硕士研究生，从事资源利用与植物保护研究，E-mail：357053147@qq.com；共同第一作者：覃悦(1992—)，男，云南昆明人，硕士研究生，从事资源植物保护与利用研究，E-mail：453276403@qq.com。
通信作者：韩长志，博士，教授，
更新日期/Last Update: 2022-03-05