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[1]杨宇婷,张强.甜叶菊多倍体变异机制的转录组及SSR分析[J].江苏农业科学,2023,51(2):44-50.
　Yang Yuting,et al.Transcriptome and SSR analysis of mechanism of polyploid variation in Stevia rebaudiana (Bertoni) Hemsl[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(2):44-50.
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甜叶菊多倍体变异机制的转录组及SSR分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第51卷
期数:
2023年第2期
页码:
44-50
栏目:
生物技术
出版日期:
2023-01-20

文章信息/Info

Title:
Transcriptome and SSR analysis of mechanism of polyploid variation in Stevia rebaudiana (Bertoni) Hemsl
作者:
杨宇婷; 张强
成都中医药大学附属医院，四川成都 610000
Author(s):
Yang Yuting; et al
关键词:
甜叶菊; 多倍体; 转录组; 简单重复序列(SSR)
Keywords:
-
分类号:
R285
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
采用BGI PE150测序平台，以二倍体甜叶菊及其同源四倍体为材料进行测序。共获得93 742个非重复序列基因(Unigene)，平均长度为754，N50达到1 278 nt。共有83 234个Unigene获得注释，其中，注释到基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)、NR库分别为50 980、28 399、65 371个。对转录组数据差异表达进行分析，筛选得到5 780个差异表达基因(DEGs)，其中，上调差异基因数目为1 832个，下调差异基因数目为3 948个。基因本体GO功能分析表明，这些差异基因主要参与细胞生长和代谢过程等相关功能。KEGG 通路富集分析表明，二、四倍体代谢水平差异是由基因层次决定的。在对甜叶菊植株加倍过程中的样品进行转录组测序中发现，10 777个简单重复序列(SSR)位点，最多的是二核苷酸，为4 386个，占SSR总数的40.70%。结果表明，四倍体甜叶菊表现出的明显器官增大、光合作用增强与差异基因显著富集在分解代谢、信号转导、碳水化合物代谢、能量代谢和氨基酸代谢等代谢通路相关。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2021-01-14
基金项目：四川省科技计划(编号：18YYJC0960)。
作者简介：杨宇婷(1987—)，女，四川成都人，药师，研究方向为药理学。E-mail：191403281@qq.com。
通信作者：张强，药师，研究方向为药理学。E-mail：zhangqiang19912021@163.com。
更新日期/Last Update: 2023-01-20