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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第51卷

期数:

2023年第5期

页码:

51-55

栏目:

“转录组学” 专栏

出版日期:

2023-03-05

文章信息/Info

Title:

Transcriptome analysis of response to drought stress in Brassica napus

作者:

张蕾; 阮羽萱; 潘娇; 陈敏; 刘博宇; 阮颖; 黄勇

湖南农业大学生物科学技术学院/湖南省作物表观遗传与发育重点实验室，湖南长沙 410128

Author(s):

Zhang Lei; et al

关键词:

甘蓝型油菜; 干旱胁迫; 转录组分析; 差异表达基因

Keywords:

-

分类号:

S634.301

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是我国主要油料作物之一，为国家粮油安全提供了重要保障。干旱严重限制了油菜种植规模扩大、产量与品质提升。为挖掘甘蓝型油菜抗旱的关键基因，阐明油菜耐旱机制，本研究以甘蓝型油菜湘油15为对象，通过实验室模拟干旱处理后的叶片为材料进行转录组测序(RNA-Seq)、生物信息分析并 qRT-PCR 验证。发现转录组样本平均Clean baseas约为9.6 G，且各样品碱基百分比(Q30)大于93.21%，比对到参考基因组上的Reads在89％以上。干旱处理4 h后，湘油15出现了440个差异表达基因(DEGs)，其中148个基因上调，292个基因下调。随机选取10个基因(上调与下调各5个)进行qRT-PCR验证，其中9个基因的qRT-PCR结果与 RNA-Seq结果相符，仅1个基因表达趋势相反，相似度可达90％，证实转录组测序结果的可靠性。结果表明甘蓝型油菜湘油15主要通过光合作用、碳代谢和渗透调节等途径调节抗旱能力，为进一步阐明油菜耐旱机制奠定了基础。

Abstract:

-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2022-06-21
基金项目：国家自然科学基金面上项目(编号：31971834)；湖南省教育厅优秀青年项目(编号：19B266)。
作者简介：张蕾(1998—)，女，湖南衡阳人，硕士研究生，从事植物分子生物学研究。E-mail：zl8398@163.com。
通信作者：黄勇，博士，教授，从事分子生物学研究。E-mail：yonghuang@hunau.edu.cn。

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更新日期/Last Update: 2023-03-05