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[1]徐盼,赵为民,倪黎纲,等.姜曲海猪ATP2B1基因克隆、生物信息学及组织表达分析[J].江苏农业科学,2023,51(8):150-156.
　Xu Pan,et al.Molecular cloning，bioinformatics and tissue expression analysis of ATP2B1 gene in Jiangquhai pigs[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(8):150-156.
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姜曲海猪ATP2B1基因克隆、生物信息学及组织表达分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第51卷
期数:
2023年第8期
页码:
150-156
栏目:
畜牧兽医与水产蚕桑
出版日期:
2023-04-20

文章信息/Info

Title:
Molecular cloning，bioinformatics and tissue expression analysis of ATP2B1 gene in Jiangquhai pigs
作者:
徐盼1; 赵为民2; 倪黎纲1; 张君胜1; 闫伟1; 刘家兴1; 陶勇1
1.江苏农牧科技职业学院动物科技学院，江苏泰州 225300； 2.江苏农业科学院畜牧研究所，江苏南京 210014
Author(s):
Xu Pan; et al
关键词:
姜曲海猪; ATP2B1基因; 克隆; 生物信息学; 组织表达
Keywords:
-
分类号:
S828.2；S828.3
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
克隆姜曲海猪质膜钙转运ATP酶1(ATPase Plasma Membrane Ca2+Transporting 1，ATP2B1)基因CDS区序列，对其进行生物信息学分析，并探究ATP2B1基因在不同日龄姜曲海猪子宫组织的表达水平，以期为研究ATP2B1基因在姜曲海猪繁殖性能方面的作用提供参考依据，采用RT-PCR技术扩增姜曲海猪子宫ATP2B1基因CDS区序列，利用生物信息学软件对其进行分析，利用实时荧光定量PCR检测ATP2B1基因在1月龄和8月龄姜曲海猪子宫组织中的表达量。结果显示，姜曲海猪ATP2B1基因CDS区全长3 663 bp，编码1 220个氨基酸，与野猪同源性最高、亲缘关系最近。姜曲海猪ATP2B1蛋白分子质量约为134 737.94 u，原子总数为19 102个，理论等电点(pI)为5.63，带正电荷、负电荷的氨基酸数分别为141、161个。该蛋白最可能位于细胞膜上，为跨膜、非分泌型疏水蛋白质，有159个磷酸化位点和5个N-糖基化位点，无规则卷曲在预测的二级结构中占比最大。实时荧光定量PCR结果显示，ATP2B1基因在8月龄姜曲海猪子宫组织中的表达量显著低于1月龄姜曲海猪子宫组织(P<0.05)。本试验为探明ATP2B1基因对猪繁殖性状的影响提供了分子理论依据。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2022-06-08
基金项目：国家自然科学基金(编号：31702089)；江苏高校“青蓝工程”；江苏农牧科技职业学院大学生创新创业训练计划(编号：202112806093Y)；江苏农牧科技职业学院科技创新团队项目(编号：NSF2021TC04)。
作者简介：徐盼(1988—)，男，江苏南京人，博士，讲师，从事动物遗传育种与繁殖研究。E-mail：panxu_nj@hotmail.com。
通信作者：陶勇，男，江苏扬州人，博士，教授，从事畜禽品种资源保护与遗传育种的教学及科研工作。E-mail：tyrsm1975@126.com。
更新日期/Last Update: 2023-04-20