|本期目录/Table of Contents|

[1]黄金,李思远,7,等.牛冠状病毒TaqMan荧光定量检测方法的建立及国内部分地区流行病学调查[J].江苏农业科学,2023,51(17):29-33.
　Huang Jin,et al.Establishment of a TaqMan-based real-time RT-PCR detection method for bovine coronavirus and epidemiological investigation in some areas of China [JY。]Huang Jin，et al(29)[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(17):29-33.
点击复制

牛冠状病毒TaqMan荧光定量检测方法的建立及国内部分地区流行病学调查(PDF)
分享到：

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第51卷
期数:
2023年第17期
页码:
29-33
栏目:
生物技术
出版日期:
2023-09-05

文章信息/Info

Title:
Establishment of a TaqMan-based real-time RT-PCR detection method for bovine coronavirus and epidemiological investigation in some areas of China [JY。]Huang Jin，et al(29)
作者:
黄金1; 2; 李思远1; 7; 谢玲玲4; 周迪4; 杨蓉4; 王松5; 周华6; 蔡旭航1; 7; 李基棕1; 2; 3; 李彬1; 2; 3
1.江苏省农业科学院兽医研究所/农业农村部兽用生物制品工程技术重点实验室，江苏南京 210014；2.南京农业大学动物医学院，江苏南京 210095； 3.江苏大学生命科学学院食品与生物工程学院，江苏镇江 212013；4.贵州省种畜禽种质测定中心，贵州贵阳 550018； 5.贵州省草地技术试验推广站，贵州贵阳 550025；6.黔西市动物疫病预防控制中心，贵州黔西 551500； 7.西北农林科技大学动物医学院，陕西杨凌 712100
Author(s):
Huang Jin; et al
关键词:
牛冠状病毒; TaqMan荧光定量; 样品检测; 隐性感染; RT-PCR
Keywords:
-
分类号:
S852.65+3
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
牛冠状病毒(BCoV)在全球广泛存在，在临床上能引起牛腹泻以及呼吸道感染，给养殖业带来巨大经济损失。为快速批量检测临床样品、分析国内的BCoV隐性感染及流行情况，根据BCoV的N基因序列设计了引物和探针，建立了TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法，对其特异性、敏感性、重复性进行评估，并将其与靶向BCoV的N基因的常规RT-PCR方法进行对比。利用本方法对采集自我国西藏、江苏、河北、贵州、安徽等5个省份的22个未发病牛场的35份口腔拭子样品和244份粪便样品进行检测以了解流行情况。结果表明，质粒标准品拷贝数的对数与CT值呈现良好稳定的负线性关系，标准曲线为y=-3.441 8x+39.584 0，r2=0.999 4，E=98.2%；最低检测拷贝数为60×10拷贝/μL，重复性变异系数均<5%；对临床样品进行检测，检出率明显高于常规RT-PCR方法。对22个牛场的279份病料进行检测，结果显示BCoV的总体阳性率为73.12%，牛场阳性率为100.00%。本研究成功建立了靶向BCoV N基因、灵敏度高、特异性好的荧光定量RT-PCR检测方法，并初步掌握了我国5个省份BCoV的流行现状，为后续BCoV研究奠定了基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］高国强，王梦心，刘明明，等. 牛冠状病毒S基因的序列分析及原核表达［J］. 中国畜牧兽医，2018，45(7)：1740-1749.
［2］Kin N，Miszczak F，Diancourt L，et al. Comparative molecular epidemiology of two closely related coronaviruses，bovine coronavirus (BCoV) and human coronavirus OC43 (HCoV-OC43)，reveals a different evolutionary pattern［J］. Infection，Genetics and Evolution，2016，40：186-191.
［3］Lapps W，Hogue B G，Brian D A.Sequence analysis of the bovine coronavirus nucleocapsid and matrix protein genes［J］. Virology，1987，157(1)：47-57.
［4］谭烁，汤承，何琪富，等. 牛冠状病毒TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用［J］. 中国预防兽医学报，2020，42(9)：918-923.
［5］Mebus C A，Stair E L，Rhodes M B，et al. Pathology of neonatal calf diarrhea induced by a coronavirus-like agent［J］. Veterinary Pathology，1973，10(1)：45-64.
［6］宋广林，董惠兰，滕庆，等. 犊牛流行性腹泻病原研究［J］. 畜牧兽医学报，1985，16(2)：121-124.
［7］何琪富，郭紫晶，李然，等. 牛冠状病毒RT-PCR检测方法的建立及应用［J］. 畜牧兽医学报，2018，49(10)：2292-2298.
［8］沈付娆，杨建乐，赵贵民，等. 牛冠状病毒SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用［J］. 中国兽医杂志，2016，52(6)：22-24，27.
［9］Decaro N，Elia G，Campolo M，et al. Detection of bovine coronavirus using a TaqMan-based real-time RT-PCR assay［J］. Journal of Virological Methods，2008，151(2)：167-171.
［10］高辉，李晓成，刘莹，等. 牛冠状病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用［J］. 黑龙江畜牧兽医，2022(6)：86-91.
［11］Decaro N，Mari V，Desario C，et al. Severe outbreak of bovine coronavirus infection in dairy cattle during the warmer season［J］. Veterinary Microbiology，2008，126(1/2/3)：30-39.
［12］杨海峰，粟灵琳，王婧，等. 我国14省市呼吸道综合征患牛冠状病毒感染的检测［J］. 畜牧与兽医，2019，51(11)：92-96.
［13］Altekruse S F，Swerdlow D L，Stern N J.Microbial food borne pathogens. Campylobacter jejuni［J］. Veterinary Clinics of North America(Food Animal Practice)，1998，14(1)：31-40.
［14］Zhu Q H，Su M J，Li Z J，et al. Epidemiological survey and genetic diversity of bovine coronavirus in Northeast China［J］. Virus Research，2022，308：198632.

相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2022-11-11
资助项目：国家重点研发计划(编号：2021YFD1801101)；江苏省自然科学基金(编号：BK20221432)。
作者简介：黄金(1999—)，女，江西省赣州市人，硕士研究生，从事动物传染病防治和诊断技术研究。E-mail：1748916481@qq.com。
通信作者：李基棕，博士，副研究员，从事家畜重要疫病的病原学、致病机制与免疫防控技术研究，E-mail：lijizong22@sina.com；李彬，博士，研究员，从事动物腹泻病防控技术、重要猪病感染与免疫的分子机制、新型疫苗和诊断试剂开发等研究，E-mail：libinana@126.com。
更新日期/Last Update: 2023-09-05