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[1]吴胜男,孙凯,张海,等.三裂叶薯KUP/HAK/KT基因家族的全基因组鉴定和表达模式分析[J].江苏农业科学,2023,51(17):52-58.
　Wu Shengnan,et al.Genome-wide identification and expression pattern analysis of KUP/HAK/KT gene family in Ipomoea triloba[JY。]Wu Shengnan，et al(52)[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(17):52-58.
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三裂叶薯KUP/HAK/KT基因家族的全基因组鉴定和表达模式分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第51卷
期数:
2023年第17期
页码:
52-58
栏目:
生物技术
出版日期:
2023-09-05

文章信息/Info

Title:
Genome-wide identification and expression pattern analysis of KUP/HAK/KT gene family in Ipomoea triloba[JY。]Wu Shengnan，et al(52)
作者:
吴胜男; 孙凯; 张海; 刘峰; 王凤
吉林省农业科学院经济植物研究所，吉林公主岭 136105
Author(s):
Wu Shengnan; et al
关键词:
三裂叶薯; KUP/HAK/KT基因家族; 系统进化; 逆境胁迫
Keywords:
-
分类号:
S531.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
KUP/HAK/KT是植物中最大的钾转运体家族，在K+的吸收和运输及生物和非生物胁迫反应中起着关键作用。为了研究三裂叶薯ItbHAK基因家族的功能特征，利用生物信息学方法对三裂叶薯ItbHAK基因家族成员进行全面的生物信息学分析，包括系统进化、基因结构、染色定位、启动子分析、组织特异性和逆境胁迫下的表达模式分析。结果显示，在三裂叶薯中共鉴定出20个ItbHAK基因，系统进化关系将其分为4个进化簇。染色体定位结果显示，20个ItbHAK基因不均匀地分布在12条染色体上。三裂叶薯基因家族的蛋白质氨基酸数量在348～1 862之间，该家族的蛋白质均被定位到质膜上。基因结构分析结果显示，部分ItbHAK基因存在外显子丢失的情况。启动子分析发现，20个ItbHAK基因均含有参与生长发育、激素和生物/非生物胁迫的响应原件。三裂叶薯ItbHAK复制分析共发现5对大片段复制事件(ItbHAK1/ItbHAK9、ItbHAK3/ItbHAK8、ItbHAK3/ItbHAK19、ItbHAK4/ItbHAK6和ItbHAK8/ItbHAK19)和1对串联复制事件(ItbHAK16/ItbHAK17)。表达模式分析发现，ItbHAK基因在不同组织和逆境胁迫下的表达模式存在差异。研究结果为阐明三裂叶薯ItbHAK 基因家族的进化关系及进一步研究三裂叶薯ItbHAK基因的功能特性提供了有价值的信息。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2022-10-31
基金项目：吉林省科技发展计划地方科技创新引导项目(编号：20210404013NC)。
作者简介：吴胜男(1993—)，男，黑龙江大庆人，硕士，主要从事甘薯遗传育种研究。E-mail：wushengnan666@163.com。
通信作者：王凤，硕士，研究员，主要从事甘薯遗传育种和栽培技术研究。E-mail：wangfeng3871@163.com。
更新日期/Last Update: 2023-09-05