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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第51卷

期数:

2023年第20期

页码:

34-42

栏目:

生物技术

出版日期:

2023-10-20

文章信息/Info

Title:

Identification and expression analysis of DUF538 gene family in tobacco under root-knot nematode stress

作者:

张路阳¹; 张有建²; 饶聪颖²; 许燕彪²; 谢可²; 李伟²; 郑聪²

1.河南农业大学烟草学院，河南郑州 450002； 2.福建省南平市烟草公司，福建南平 353000

Author(s):

Zhang Luyang; et al

关键词:

烟草; DUF538基因; 全基因组鉴定; 生物信息学; 表达分析; 根结线虫

Keywords:

-

分类号:

S572.01

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

DUF538基因是没有功能注释的蛋白，在根结线虫胁迫的响应过程中，含有DUF538结构域的蛋白质的基因表达发生变化。鉴定烟草DUF538基因家族，为烟草DUF538基因功能研究提供理论依据，有利于筛选防御根结线虫的有效基因。基于烟草全基因组数据，通过BLAST对烟草DUF538基因家族进行鉴定，利用生物信息学的方法分析了该家族成员的理化性质、基因结构、蛋白质结构域、染色体分布、系统进化及启动子，并利用qRT-PCR验证了DUF538基因家族在K326各个组织的表达情况及响应南方根结线虫侵染的表达情况。结果表明，烟草中共鉴定出8个NtDUF538基因，将其分为3类；已知的NtDUF538基因位于不同的染色体上且分布不均匀，所有NtDUF538基因均具有保守的结构域；NtDUF538基因家族启动子区域显著富集生长发育和激素响应的顺式元件，部分NtDUF538基因还具有低温胁迫的作用元件；7个NtDUF538基因在K326不同组织中存在不同程度的表达，NtDUF538-7基因只在叶和花中表达，其中NtDUF538-5和NtDUF538-6在遭受根结线虫侵染后表达量增加。研究结果揭示了烟草NtDUF538基因家族成员在根结线虫侵染过程中起到重要作用，为探究烟草NtDUF538基因家族的生物学功能提供了理论基础。

Abstract:

-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2023-01-06
基金项目：浙江中烟工业有限责任公司项目(编号：NYK2022-04-03)。
作者简介：张路阳(1997—)，男，河南郑州人，硕士研究生，主要从事烟草育种研究。E-mail：zhangluyang97@126.com。
通信作者：郑聪，硕士，农艺师。E-mail：npyczc@163.com。

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更新日期/Last Update: 2023-10-20