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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第51卷

期数:

2023年第22期

页码:

14-23

栏目:

生物技术

出版日期:

2023-12-04

文章信息/Info

Title:

Cloning of PtIPT5 gene in Populus trichocarpa and its expression analysis under low temperature stress

作者:

毕田田¹; 张骐¹; 代金玲¹; 高秀芳²; 白玉娥¹

1.内蒙古农业大学林学院，内蒙古呼和浩特 010000； 2.鄂尔多斯市林业和草原事业发展中心，内蒙古鄂尔多斯 017000

Author(s):

Bi Tiantian; et al

关键词:

毛果杨; PtIPT5基因; 克隆; 低温胁迫; 生物信息学; 表达分析

Keywords:

-

分类号:

S792.113.01

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

为探究异戊稀基转移酶基因(IPT)的抗逆机理，通过PCR技术从毛果杨叶片中克隆了IPT基因，命名为PtIPT5，对该基因及其蛋白进行生物信息学分析，并使用实时荧光定量技术(qRT-PCR)分析其在毛果杨组培苗不同组织及不同程度低温处理下的表达特性。结果表明，PtIPT5基因编码区(coding sequence，CDS)长度为984 bp，可编码327个氨基酸残基；PtIPT5蛋白为稳定亲水蛋白，且无信号肽和跨膜结构，含有GxxGxGK［S，T］保守基序；系统进化树分析结果显示，毛果杨PtIPT5蛋白与美洲黑杨、红皮柳等杨柳科植物的IPT亲缘关系较近；同源蛋白结构域分析结果显示，IPT蛋白高度保守，只有Cas3_I superfamily结构域；亚细胞定位预测PtIPT5蛋白位于叶绿体中；启动子分析结果显示，PtIPT5基因的启动子序列包含多种胁迫响应的顺式作用元件；PtIPT5基因在毛果杨茎段、顶芽、腋芽、主根、侧根、幼嫩叶、扩展叶和黄化衰老叶中均有表达，其中在顶芽、根部和幼嫩叶中相对表达量较高；低温胁迫下，PtIPT5基因的相对表达量随温度降低和胁迫时间增加显著下降，据此推测该基因响应低温胁迫并发挥调控作用。

Abstract:

-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2023-01-02
基金项目：国家科技重大专项(编号：2018ZX08020002-005-005)。
作者简介：毕田田(1997—)，女，辽宁朝阳人，硕士研究生，主要从事林木生物技术研究。E-mail：1756988574@qq.com。
通信作者：白玉娥，博士，教授，主要从事林木遗传育种研究。E-mail：baiyue@imay.edu.cn。

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更新日期/Last Update: 2023-11-20