|本期目录/Table of Contents|

[1]李大命,杨子萍,刘燕山,等.基于线粒体Cytb基因的江淮下游6个湖泊翘嘴鲌群体遗传多样性分析[J].江苏农业科学,2024,52(3):213-220.
　Li Daming,et al.Study on genetic diversity of Culter alburnus from six freshwater lakes in the lower reaches of the Yangtze and Huaihe Rivers based on mitochondrial DNA Cytb gene[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2024,52(3):213-220.
点击复制

基于线粒体Cytb基因的江淮下游6个湖泊翘嘴鲌群体遗传多样性分析(PDF)
分享到：

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第52卷
期数:
2024年第3期
页码:
213-220
栏目:
畜牧兽医与水产蚕桑
出版日期:
2024-02-05

文章信息/Info

Title:
Study on genetic diversity of Culter alburnus from six freshwater lakes in the lower reaches of the Yangtze and Huaihe Rivers based on mitochondrial DNA Cytb gene
作者:
李大命1; 杨子萍1; 2; 刘燕山1; 唐晟凯1; 谷先坤1; 殷稼雯1
1.江苏省淡水水产研究所/江苏省内陆水域渔业资源重点实验室，江苏南京 210017； 2.南京师范大学海洋科学与工程学院，江苏南京 210023
Author(s):
Li Daming; et al
关键词:
翘嘴鲌; Cytb基因; 遗传多样性; 遗传分化; 种群历史动态
Keywords:
-
分类号:
S917
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
以线粒体Cytb基因作为分子标记对长江、淮河下游6个湖泊翘嘴鲌群体共262尾个体的遗传多样性、遗传分化及历史动态进行分析。结果显示，翘嘴鲌Cytb基因序列全长为1 141 bp，碱基A+T的含量(55.9%)高于G+C含量(44.1%)。262条Cytb基因序列检出42个变异位点，定义46个单倍型，总群体单倍型和核苷酸多样性分别为0916±0.010和0.00 256±0.00 008；6个群体的单倍型多样性为(0.798±0.059)~(0.927±0.019)，核苷酸多样性为(0002 04±0.000 27)~(0.002 85±0.000 18)，表明翘嘴鲌遗传多样性属于高Hd和低Pi模式。基于单倍型构建的系统发育树和进化网络图显示，6个群体的单倍型未形成明显的地理格局。分子方差分析(AMOVA)显示，遗传变异主要来自于群体内部(91.64%)，群体间遗传分化系数(Fst)为0.083 62(P<0.01)；6个群体间的Fst为 -0.004 27~0.155 29，其中，长江群体和淮河群体间均具有显著中度或高度遗传分化(P<0.05)。中性检验结果显示，Tajimas D和Fus Fs均为负值(P<0.05)，核苷酸不配对分布曲线呈现单峰型，表明翘嘴鲌群体在历史上经历过显著的种群扩张。整体来看，江淮下游湖泊的翘嘴鲌野生种质资源遗传多样性较低，长江水系群体和淮河水系群体间有显著的遗传分化，应采取措施恢复翘嘴鲌资源量及提高其遗传多样性，并将长江流域和淮河流域湖泊群体划分为不同的管理单元进行保护。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］乐佩琦，罗云林. 鲌亚科类系统发育初探(鲤形目：鲤科)［J］. 水生生物学报，1996，20(2)：182-185.
［2］覃亮，熊邦喜，王基松，等. 鲌属鱼类在天然水域中的生态功能及资源增殖对策［J］. 湖北农业科学，2009，48(1)：233-236.
［3］徐慧东，苗畅齐，韩英. 兴凯湖翘嘴鲌的生物学研究与养殖概况［J］. 水产学杂志，2014，27(5)：59-64.
［4］黄艳飞，段国旗，彭林平. 翘嘴鲌的资源现状和生物学特征综述［J］. 安徽农业科学，2019，47(19)：10-13.
［5］凌去非，谭夕东，许爱国. 澄湖翘嘴鲌的生长与资源保护［J］. 水利渔业，2006，27(4)：30-32.
［6］程鹏，樊启学，陈年林，等. 赤东湖翘嘴鲌人工繁殖和苗种培育技术研究［J］. 水利渔业，2007，28(1)：22-23.
［7］吕帅帅，管卫兵，何文辉. 太湖翘嘴鲌的生物学特性和条件状况研究［J］. 江苏农业科学，2013，41(5)：196-199.
［8］吕大伟，周彦锋，葛优，等. 淀山湖翘嘴鲌的年龄结构与生长特性［J］. 水生生物学报，2018，42(4)：762-769.
［9］丁德明，陈杏华，伍远安，等. 不同养殖模式翘嘴鲌肌肉营养品质比较［J］. 中国饲料，2021(1)：89-95.
［10］李国庆，伍育源，秦志峰，等. 鱼类遗传多样性研究［J］. 水产科学，2004，23(8)：42-44.
［11］张亚平，施立明. 动物线粒体DNA多态性的研究概况［J］. 动物学研究，1992，13(3)：289-298.
［12］蓝昭军，李强，舒琥，等. 基于线粒体细胞色素b基因的光倒刺鲃遗传多样性与遗传结构研究［J］. 海洋与湖沼，2016，47(6)：1158-1165.
［13］李大命，唐晟凯，刘燕山，等. 基于Cytb基因的江苏省湖鲚种群遗传多样性和遗传结构分析［J］. 中国农学通报，2021，37(20)：144-151.
［14］李大命，唐晟凯，刘燕山，等. 江苏省4个太湖新银鱼种群遗传多样性和遗传结构分析［J］. 渔业科学进展，2020，41(5)：52-60.
［15］杨子拓. 珠江流域三种鲌亚科鱼类的遗传结构及遗传多样性分析［D］. 广州：华南农业大学，2016.
［16］黄小彧. 长江水系翘嘴鲌遗传多样性研究［D］. 广州：暨南大学，2012.
［17］王伟，陈立侨，禹娜，等. 应用COⅡ基因部分序列分析翘嘴鲌群体的遗传多样性［J］. 大连水产学院学报，2008，23(5)：403-408.
［18］伊西庆. 中国东部6个大型湖泊翘嘴鲌(Culter alburnus)遗传多样性的线粒体ND2基因序列分析［D］. 广州：暨南大学，2009.
［19］Xiao W H，Zhang Y P，Liu H Z. Molecular systematics of Xenocyprinae (Teleostei：Cyprinidae)：taxonomy，biogeography，and coevolution of a special group restricted in East Asia［J］. Molecular Phylogenetics and Evolution，2001，18(2)：163-173.
［20］李文静，王环珊，刘焕章，等. 赤水河半餐鱼的遗传多样性和种群历史动态分析［J］. 水生生物学报，2018，42(1)：106-113.
［21］王丹，程庆武，杨镇宇，等. 三峡库区鲌属鱼类线粒体 COⅠ基因遗传多样性的初步分析［J］. 水生生物学报，2015，39(5)：1054-1058.
［22］李大命，唐晟凯，刘燕山，等. 基于Cytb基因的江苏省大银鱼种群遗传多样性和遗传结构分析［J］. 上海海洋大学学报，2021，30(3)：416-425.
［23］李大命，唐晟凯，刘燕山，等. 基于线粒体COⅠ基因序列的江苏省4个太湖新银鱼群体遗传多样性分析［J］. 海洋渔业，2020，42(3)：277-286.
［24］Grant W，Bowen B. Shallow population histories in deep evolutionary lineages of marine fishes：insights from sardines and anchovies and lessons for conservation［J］. Journal of Heredity，1998，89(5)：415-426.
［25］Qi P Z，Guo B Y，Xie C X，et al. Assessing the genetic diversity and population structure of Culter alburnus in China based on mitochondrial 16S rRNA and COⅠ gene sequences［J］. Biochemical Systematics and Ecology，2013，50：390-396.
［26］Sun N，Zhu D M，Li Q，et al. Genetic diversity analysis of Topmouth Culter (Culter alburnus) based on microsatellites and D-loop sequences［J］. Environmental Biology of Fishes，2021，104(3)：213-228.
［27］李大命，刘洋，唐晟凯，等. 基于Cytb基因的滆湖鲌类国家级水产种质资源保护区3种鲌鱼的遗传多样性分析［J］. 水产科技情报，2022，49(1)：1-7.
［28］Fu Y X. Statistical tests of neutrality of mutations against population growth，hitchhiking and background selection［J］. Genetics，1997，147(2)：915-925.
［29］Márcia Barbosa A，Real R，Muoz A R，et al. New measures for assessing model equilibrium and prediction mismatch in species distribution models［J］. Diversity and Distributions，2013，19(10)：1333-1338.
［30］OBrien S J. A role for molecular genetics in biological conservation［J］. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America，1994，91(13)：5748-5755.
［31］Balloux F，Lugon-Moulin N.The estimation of population differentiation with microsatellite markers［J］. Molecular Ecology，2002，11(2)：155-165.
［32］Perdices A，Sayanda D，Coelho M M.Mitochondrial diversity of Opsariichthys bidens (Teleostei，Cyprinidae) in three Chinese drainages［J］. Molecular Phylogenetics and Evolution，2005，37(3)：920-927.
［33］Xia Y Z，Chen Y Y，Sheng Y. Phylogeographic structure of lenok (Brachymystax lenok Pallas) (Salmoninae，Salmonidae) populations in water systems of Eastern China，inferred from mitochondrial DNA sequences［J］. Zoological Studies，2006，45(2)：190-200.

相似文献/References:

[1]吕帅帅,管卫兵,何文辉.太湖翘嘴鲌的生物学特性和条件状况研究[J].江苏农业科学,2013,41(05):196.
　Lv Shuaishuai,et al.Study on biological characteristics and conditions of Culter alburnus in Taihu Lake[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(3):196.
[2]臧胜芹,陈晓勇,杨凌,等.绵羊Cytb基因生物信息学分析[J].江苏农业科学,2018,46(18):24.
　Zang Shengqin,et al.Bioinformatics analysis of Cytb gene in sheep[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(3):24.
[3]李大命,张彤晴,唐晟凯,等.基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的洪泽湖湖鲚遗传多样性分析[J].江苏农业科学,2018,46(20):36.
　Li Daming,et al.Study on genetic diversity of Coilia nasus population in Lake Hongze based on mtDNA Cytb gene and D-loop sequences[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(3):36.
[4]程顺,顾志敏,刘士力,等.翘嘴鲌精子生理特性及超低温冷冻的研究[J].江苏农业科学,2019,47(07):175.
　Cheng Shun,et al.Study on physiological characteristics and ultra-low temperature freezing of Culter alburnus sperm[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(3):175.
[5]李大命,刘洋,唐晟凯,等.基于COⅠ基因的滆湖鲌类国家级水产种质资源保护区3种鲌类的遗传多样性分析[J].江苏农业科学,2021,49(20):177.
　Li Daming,et al.Genetic diversity of three Culter spp. in aquatic germplasm resources protection district of Ge Lake based on COⅠ gene sequence[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(3):177.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2023-03-21
基金项目：江苏省农业科技自主创新资金［编号：CX(21)3003］；渔业生态与资源监测项目(编号：2021-SJ-110-03、2022-SJ-061-02)。
作者简介：李大命(1981—)，男，河南汝南人，博士，研究员，研究方向为渔业种质资源监测和保护。E-mail：ldm8212@126.com。
更新日期/Last Update: 2024-03-05