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[1]刘湘楠,胡祥祥,乔梦燚,等.红花Aux/IAA基因家族鉴定及盐胁迫响应分析[J].江苏农业科学,2024,52(6):68-76.
　Liu Xiangnan,et al.Identification of Aux/IAA gene family and analysis of salt stress response in Carthamus tinctorius[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2024,52(6):68-76.
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红花Aux/IAA基因家族鉴定及盐胁迫响应分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第52卷
期数:
2024年第6期
页码:
68-76
栏目:
生物技术
出版日期:
2024-03-20

文章信息/Info

Title:
Identification of Aux/IAA gene family and analysis of salt stress response in Carthamus tinctorius
作者:
刘湘楠1; 胡祥祥1; 乔梦燚1; 周丹宁1; 朱畇昊1; 2
1.河南中医药大学药学院，河南郑州 450046； 2.呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心，河南郑州 450046
Author(s):
Liu Xiangnan; et al
关键词:
红花; Aux/IAA基因家族; 生物信息学分析; 盐胁迫
Keywords:
-
分类号:
S567.21+9.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为了对红花Aux/IAA基因家族进行生物信息学分析，研究该基因在红花生长发育中的调控作用，利用生物信息学方法，在红花全基因组中鉴定出28个Aux/IAA基因。根据其与拟南芥Aux/IAA基因的系统发育关系，使用MEGA 7.0做出系统发育进化树。经理化性质分析，红花Aux/IAA蛋白为亲水性蛋白，且79%位于细胞核中，大多数红花Aux/IAA蛋白表现为偏酸性；经聚类分析，将红花Aux/IAA基因分为5个亚族。基因结构分析表明，所有基因均含有 1~9个内含子。这些基因在红花的9条染色体上非均匀地分布，其中9号染色体上分布最多，有7个Aux/IAA基因。红花Aux/IAA基因在不同发育期及不同外源激素处理下表达量各不相同。对保守基序作图分析发现，大部分红花Aux/IAA 蛋白具有 4 个共同的保守基序，分别为motif 1、motif 2、motif 3、motif 4，qRT-PCR结果表明，不同浓度盐胁迫处理24 h后，基因CtAux/IAA1相对表达量呈上调趋势，推测此基因可能与提高红花抗盐胁迫能力有关。本研究结果将有助于了解红花Aux/IAA基因家族在生长发育过程中的功能并筛选优良基因。
Abstract:
-

参考文献/References:

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　Hu Xiangxiang,et al.Identification and expression analysis of CDPK gene family in Carthamus tinctorius[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(6):39.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2023-06-16
基金项目：国家自然科学基金(编号：81603232)；国家重点研发计划(编号：2017YFC1702800)；河南省重大科技专项(编号：171100310500)；河南省科技攻关项目(编号：172102310539)。
作者简介：刘湘楠(2000—)，女，河南许昌人，硕士研究生，主要从事药用植物分子生物研究。E-mail：1296969180@qq.com。
通信作者：朱畇昊，博士，副教授，主要从事药用植物分子生物研究。E-mail：guxinhan123@163.com。
更新日期/Last Update: 2024-03-20