[1]石远帅,陆俊,丁丹,等.烟草钾转运蛋白KUP基因家族鉴定与表达分析[J].江苏农业科学,2025,53(4):100-110.
　Shi Yuanshuai,et al.Identification and expression analysis of potassium transporter KUP gene family in Nicotiana tabacum L.[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2025,53(4):100-110.
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烟草钾转运蛋白KUP基因家族鉴定与表达分析()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第53卷
期数:
2025年第4期
页码:
100-110
栏目:
耐养分胁迫基因
出版日期:
2025-02-20

文章信息/Info

Title:
Identification and expression analysis of potassium transporter KUP gene family in Nicotiana tabacum L.
作者:
石远帅; 陆俊; 丁丹; 樊一丹; 刘洋
贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室，贵州贵阳 550025
Author(s):
Shi Yuanshuai; et al
关键词:
烟草; KUP基因家族; 钾转运蛋白; 生物信息学; 表达模式; 低钾胁迫; 干旱胁迫
Keywords:
-
分类号:
S188；S572.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
烟草是我国重要的经济作物，对钾素需求量较大。KUP家族是目前已知的最大的钾离子转运蛋白家族，在钾离子吸收和转运方面起着重要作用。对烟草KUP基因家族进行鉴定和分析，并探究其在低钾胁迫下的表达模式，可为进一步研究和利用烟草KUP基因奠定基础。本研究采用生物信息学方法在烟草基因组中鉴定KUP家族，且对家族成员的理化性质、系统进化关系、保守基序、基因结构、共线性分析、Ka/Ks值、顺式作用元件等进行分析，并探明KUP基因家族成员在根、茎、叶、花等不同组织及干旱胁迫条件下的表达模式；最后通过qRT-PCR方法分析其在低钾胁迫下的表达模式。生物信息学分析结果显示：在烟草K326基因组中共鉴定出39个KUP基因，家族成员均含有一个典型的“K_trans superfamily”结构域，其中26个被定位在13条染色体上，存在7对共线性基因对，有3对基因对的Ka/Ks值远远小于1，有1对基因对的Ka/Ks值大于1；KUP家族蛋白均为疏水性蛋白，其基因上游启动子区均包含多个激素和胁迫元件。转录组数据表明：NtKUP家族基因大部分成员在根和花中高表达，少部分在茎和叶中高表达，且部分成员在花中表达量随着成熟度逐渐降低；大多数基因对干旱胁迫存在响应。挑选4个NtKUP基因进行qRT-PCR分析，试验结果表明：KUP2、KUP4、KUP8在低钾胁迫下根中的表达量有不同程度的上调，且根中的表达量远远高于叶，这和NtKUP家族大部分成员在根中参与低钾胁迫响应的生物信息学分析相一致。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2024-05-16
基金项目：贵州省烟草公司重点研发项目(编号：2021XM04)。
作者简介：石远帅(2000—)，男，贵州黔南人，硕士研究生，主要从事烟草遗传育种研究。E-mail：1765994937@qq.com。
通信作者：刘洋，博士，副教授，主要从事烟草遗传育种研究。E-mail：yliu21@gzu.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2025-02-20