[1]冯鹏宇,裴徐梨,焦鹏,等.不同激素处理下青花菜lncRNA内参基因的筛选[J].江苏农业科学,2025,53(10):36-42.
 Feng Pengyu,et al.Screening of lncRNA reference genes in broccoli under different hormone treatments[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2025,53(10):36-42.
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不同激素处理下青花菜lncRNA内参基因的筛选()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第53卷
期数:
2025年第10期
页码:
36-42
栏目:
生物技术
出版日期:
2025-05-20

文章信息/Info

Title:
Screening of lncRNA reference genes in broccoli under different hormone treatments
作者:
冯鹏宇1裴徐梨1焦鹏1唐征2荆赞革1徐胜光1宋立晓3杞汝春1徐谦2
1.昆明学院农学与生命科学学院,云南昆明 650214; 2.温州科技职业学院农业与生物技术学院,浙江温州 325006;3.江苏省农业科学院农产品质量安全与营养研究所,江苏南京 210014
Author(s):
Feng Pengyuet al
关键词:
青花菜内参基因长链非编码RNAqRT-PCR激素处理
Keywords:
-
分类号:
S635.301
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为了筛选青花菜不同激素处理条件下稳定表达的内参基因,为青花菜lncRNAs相关分子研究提供参考,通过qRT-PCR技术检测不同激素处理的青花菜中16个候选内参基因的表达量,利用GeNorm 、NormFinder和BestKeeper软件分析内参基因的稳定性和最适内参基因的数目,再通过RefFinder网站综合评估内参基因,最终确定理想的内参基因。结果表明,XLOC_007087、XLOC_015579和XLOC_008536基因的CT值变化范围最小。GeNorm算法认为XLOC_008536在6-BA、ABA、IAA、NAA处理中表达稳定性较好;XLOC_037050在MEJA、SA处理中表现的稳定性较好。NormFinder计算出NAA、ABA处理下XLOC_037050最稳定;6-BA处理下,基因XLOC_021473最稳定;MEJA处理下,最稳定的基因为XLOC_010342;SA处理下,XLOC_034687最稳定;IAA处理下,XLOC_029328最稳定。BestKeeper显示,在6-BA、MEJA处理下,表达最稳定的基因是XLOC_007087;NAA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_015579;ABA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_012179;SA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_010342;IAA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_007980。3个软件的分析结果不尽相同,RefFinder综合分析结果显示,在NAA和ABA处理下适宜的内参基因为XLOC_037050;MEJA处理下适宜的内参基因为XLOC_010342;6-BA处理下适宜的内参基因为XLOC_021473;SA处理下适宜的内参基因为XLOC_034687;IAA处理下适宜的内参基因为XLOC_007980。4个软件综合分析认为,在不同激素胁迫中适宜的内参基因组合为XLOC_008536和XLOC_007087
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2023-11-03
基金项目:云南省科技计划重大科技专项(编号:202202AE090015);云南省地方本科高校(部分)基础研究联合专项(编号:2018FH001-044);云南省基础研究专项青年项目(编号:2019-1-C-25318000002236);浙江省自然科学基金(编号:LY18C150006);浙江省农业(蔬菜新品种选育)新品种选育重大科技专项(编号:2021C02065-4-2);温州市科技项目(编号:2019ZX007-2、N2016001);昆明市产业技术领军人才项目。
作者简介:冯鹏宇(1996—),男,云南曲靖人,硕士研究生,主要从事资源利用与植物保护研究。E-mail:1535332408@qq.com。
通信作者:荆赞革,博士,副研究员,主要从事蔬菜遗传育种与生物技术研究。E-mail:jingzange@aliyun.com。
更新日期/Last Update: 2025-05-20