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[1]胡军华,王大伟,杨明磊,等.番茄C2H2型锌指蛋白的鉴定及生物信息学分析[J].江苏农业科学,2018,46(12):23-27.
　Hu Junhua,et al.Identification and bioinformatics analysis of C2H2-type zinc finger protein in Solanum lycopersicum[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(12):23-27.
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番茄C2H2型锌指蛋白的鉴定及生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第46卷
期数:
2018年第12期
页码:
23-27
栏目:
生物技术
出版日期:
2018-06-20

文章信息/Info

Title:
Identification and bioinformatics analysis of C2H2-type zinc finger protein in Solanum lycopersicum
作者:
胡军华1; 2;  王大伟1;  杨明磊1; 2;  王新1; 2;  朱海2;  朱佩2;  刘贯山1
1.中国农业科学院烟草研究所/烟草行业烟草基因资源利用重点实验室，山东青岛 266101； 2.中国农业科学院研究生院，北京 100081
Author(s):
Hu Junhua; et al
关键词:
C2H2型锌指蛋白; 番茄; 生物信息学; 进化树; 结构域; 染色体定位; 组织表达
Keywords:
-
分类号:
S641.201
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
植物C2H2型锌指蛋白转录因子广泛参与植物的生长发育及对逆境应答反应等生命过程。为了更好地理解番茄中C2H2型锌指蛋白转录因子的种类和数量，利用番茄基因组数据库，鉴定出92条番茄C2H2型锌指蛋白。蛋白质理化分析结果表明，不同亚家族成员的氨基酸长度差异较大，且多为碱性氨基酸；进化树分析结果表明，所有C2H2家族成员被分为5个亚家族，每个亚家族成员数量差异较大；结构域分析显示每个成员都含有C2H2结构域，同一亚家族间结构域的数量、种类、分布具有一致性；染色体定位结果显示，有91个成员定位在12条染色体上；组织表达分析结果表明，C2H2转录因子基因家族成员在各个组织中都有表达，表达量具有差异性。本研究将为番茄C2H2型锌指蛋白的生物学功能分析提供参考。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2016-12-07
基金项目：国家烟草专卖局烟草基因组计划重大专项［编号：110201301005(JY-05)］；中国农业科学院烟草研究所青年科学基金(编号：2015B05)。
作者简介：胡军华(1990—)，男，安徽黄山人，硕士研究生，主要从事烟草突变体鉴定与利用方向的研究。E-mail：1577209402@qq.com。
通信作者：刘贯山，研究员，博士生导师，主要从事烟草分子育种研究。E-mail：liuguanshan@caas.cn。
更新日期/Last Update: 2018-06-20