«上一篇/Previous Article|本期目录/Table of Contents|下一篇/Next Article»

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第46卷

期数:

2018年第23期

页码:

45-49

栏目:

生物技术

出版日期:

2018-12-05

文章信息/Info

Title:

Analysis of transferability and polymorphism of onion EST-SSR markers in Welsh onions

作者:

王其鹏¹;  王丽乔²;  张巍巍³;  袁瑞江²;  冯大领³

1.河北农业大学现代科技学院，河北保定 071000； 2.石家庄市农林科学研究院蔬菜研究所，河北石家庄 050021；
3.河北农业大学生命科学学院，河北保定 071000

Author(s):

Wang Qipeng; et al

关键词:

大葱; 洋葱; EST-SSR标记; 通用性; 多态性

Keywords:

-

分类号:

S633.103.2

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

以31个大葱自交系为材料，用14个洋葱EST-SSR标记，对各个自交系的PCR扩增产物进行分析。结果表明，其中13个EST-SSR标记在大葱不同自交系上具有通用性，1个标记(ACM024)在31个大葱自交系上没有扩增产物，可用于大葱与洋葱的区分；13对引物在31个自交系中共检测到等位位点28个，平均每对引物可以检测到2.15个；通过扩增产物的多态性分析，10个引物具有多态性；通过聚类分析获得了各个自交系间的遗传距离及各自交系间的亲缘关系。在相似性系数0.72水平上，自选材料1、日本品种山木一本与其他类型关系较远。各自交系间的遗传距离在0~2.11之间，其中遗传距离最小为0(2013年山东田选寒青巨葱与大梧桐象青叶1号；河北无极鸡腿葱与赞皇选日本型大葱；横滨大葱与自选材料6)，遗传距离最大值为2.11(自选材料1与山木一本)。该研究为大葱品种鉴定、遗传多样性分析、遗传图谱构建等奠定了基础。

Abstract:

-

参考文献/References:

［1］中国农业科学院蔬菜花卉研究所.中国蔬菜品种志［M］. 北京：中国农业科技出版社，2002.
［2］韩春然. 大葱提取物对微生物抑制作用的研究［J］. 食品研究与开发，2007，28(6)：65-68.
［3］苗锦山，刘彩霞，杨文才，等. 葱种质资源品质性状的遗传多样性研究［J］. 西北农业学报，2012，21(3)：122-131.
［4］Graner A，Varshney R，Michalek W，et al. Exploiting EST databases for the development and characterization of gene-derived SSR-markers in barley (Hordeum vulgare L.)［J］. Theoretical and Applied Genetics，2003，106(3)：411-422.
［5］姜春芽，廖娇，徐小彪，等. 植物EST-SSR技术及其应用［J］. 分子植物育种，2009，7(1)：125-129.
［6］杨维泽，许宗亮，杨绍兵，等. 三种植物EST-SSR引物在滇重楼上的通用性分析［J］. 西南农业学报，2014(4)：1686-1690.
［7］文明富，陈新，王海燕，等. 木薯基因组SSR和EST-SSR在麻疯树和橡胶树中的通用性分析［J］. 作物学报，2011，37(1)：74-78.
［8］Fukuoka H，Nunome T，Minamiyama Y，et al. Read2Marker：a data processing tool for microsatellite marker development from a large data set［J］. BioTechniques，2005，39(4)：472，474，476.
［9］Kuhl J C，Cheung F，Yuan Q，et al. A unique set of 11，008 onion expressed sequence tags reveals expressed sequence and genomic differences between the monocot orders Asparagales and Poales［J］. Plant Cell，2004，16(1)：114-125.
［10］Martin W J，McCallum J，Shigyo M，et al. Genetic mapping of expressed sequences in onion and in silico comparisons with rice show scant colinearity［J］. Molecular Genetics and Genomics，2005，274(3)：197-204.
［11］Hikaru T，Ken-Ichiro Y，Shigenori Y，et al. Construction of SSR-based chromosome map in bunching onion(Allium fistulosum)［J］. Theoretical and Applied Genetics，2008，117(8)：1213-1223.
［12］Lakshmana R，Khandagale K，Aswath C，et al. Molecular markers in the improvement of Allium crops［J］. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding，2013，49(4)：131-139.
［13］Kutty M S，Gowda R V，Anand L. Analysis of genetic diversity among Indian short-day onion(Allium cepa L.)cultivars using RAPD markers［J］. Journal of Horticultural Science and Biotechnology，2006，81(4)：774-777.
［14］Xu P，Liu H，Gao Z，et al. Genetic identification of garlic cultivars and lines by using RAPD assay［J］. Acta Horticulturae(ISHS)，2001，555：213-220.
［15］徐启江，崔成日，贾铁金.洋葱种质资源遗传多样性的ISSR分析［J］. 中国农学通报，2007，23(6)：126-130.
［16］高莉敏，董飞，霍雨猛，等. 大葱细胞质雄性不育基因的SCAR标记开发［J］. 园艺学报，2013，40(7)：1382-1388.
［17］盖树鹏，孟祥栋. 大葱胞质雄性不育位点RAPD标记转化为SCAR标记的研究［J］. 莱阳农学院学报，2004，21(3)：189-192.
［18］Khar A，Lawande K E，Negi K S. Microsatellite marker based analysis of genetic diversity in short day tropical Indian onion and cross amplification in related Allium spp.［J］. Genetic Resources and Crop Evolution，2011，58(5)：741-752.
［19］钟敏，程须珍，王丽侠，等. 绿豆基因组SSR引物在豇豆属作物中的通用性［J］. 作物学报，2012，38(2)：223-230.
［20］向闱，宁祖林，康明，等. 中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性［J］. 热带亚热带植物学报，2010，18(6)：665-669.
［21］柴呈森，姜蔚，李娜，等. 单、双子叶作物间EST-SSRs引物和标记的通用性研究［J］. 西北农林科技大学学报(自然科学版)，2010，38(1)：75-82.
［22］李青燕，陈向东，董娜，等. 利用分子标记建立杂交小麦亲本分子指纹图谱［Ｊ］. 江苏农业科学，２０１６，４４（９）：３２-３４.
［23］梁田，杨霞，张勋，等. 绵羊Toll样受体７基因多态性分析［Ｊ］. 江苏农业科学，２０１７，４５（８）：２６-２９.
［24］宋慧，王毓洪，张香琴. 瓠瓜类型砧木遗传作图群体双亲多态性分析［Ｊ］. 江苏农业科学，２０１６，４４（１１）：４８-５０.
［25］陈明辉，张志录，杨雨华，等. 红豆杉种质资源遗传多样性的目标起始密码子多态性（ＳＣｏＴ）分析［Ｊ］. 江苏农业科学，２０１６，４４（１０）：１１６-１１９.
［26］杨阳，刘振，赵洋，等. 利用EST-SSR标记研究黄金茶群体遗传多样性及遗传分化［J］. 茶叶科学，2009，29(3)：236-242.

相似文献/References:

[1]单成海.镉、铅胁迫对洋葱种子萌发的影响[J].江苏农业科学,2013,41(04):160.
[2]潘天春.洋葱育种的探索与实践[J].江苏农业科学,2013,41(05):119.
　Pan Tianchun,et al.Exploration and practice of breeding of onion[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(23):119.
[3]苏建红,漆永红,郭成,等.洋葱贮藏期主要病害研究进展[J].江苏农业科学,2014,42(10):141.
　Su Jianhong,et al.Research progress of major diseases of onion during storage period[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(23):141.
[4]郭庆龙,崔淑华,张晓梅,等.二甲戊灵在大葱中的残留分析与消解动态[J].江苏农业科学,2013,41(07):307.
　Guo Qinglong,et al.Residues and degradation dynamics analysis of pendimethalin in Allium fistulosum[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(23):307.
[5]赵丽华.洋葱组培外植体消毒灭菌技术[J].江苏农业科学,2013,41(09):34.
　Zhao Lihua.Study on disinfection and sterilization techniques of onion tissue culture explants[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(23):34.
[6]单成海.盐碱胁迫对洋葱部分理化特性的影响[J].江苏农业科学,2013,41(11):193.
　Shan Chenghai.Effect of saline-alkaline stress on partial physicochemical properties of onion[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(23):193.
[7]孙永生,崔连伟,贾俊香,等.部分大葱品种表型性状的初步分析与比较[J].江苏农业科学,2014,42(01):120.
　Sun Yongsheng,et al.Study on phenotype characteristics of some welsh onion varieties[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(23):120.
[8]张仕林,许玉超,帅强,等.洋葱不同组织RNA提取方法比较分析[J].江苏农业科学,2016,44(10):95.
　Zhang Shilin,et al.Comparison of RNA extraction methods for different tissues of onion (Allium cepa L.)[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(23):95.
[9]赵锦慧,周琳.钠离子对洋葱细胞程序性死亡的诱导[J].江苏农业科学,2016,44(11):189.
　Zhao Jinhui,et al.Study on programmed cell death induced by Na+ in onion[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(23):189.
[10]程雨,宋策,陈典,等.洋葱细胞质雄性不育系小孢子败育的细胞形态学结构[J].江苏农业科学,2017,45(07):107.
　Cheng Yu,et al().Cell morphological structure of microspore abortion in cytoplasmic male sterility line of onion[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(23):107.

备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2017-08-12
基金项目：河北省科技支撑计划(编号：14226306D-6)；河北省科技厅农业关键共性技术攻关专项(编号：16226304D-3)；河北农业大学大学生创新创业训练计划(编号：cxzr2014009)。
作者简介：王其鹏(1994—)，男，山东德州人，主要从事植物分子生物学及基因组学的研究。E-mail：1261870339@qq.com。
通信作者：袁瑞江，研究员，主要从事蔬菜育种和栽培等研究工作，E-mail：yrj208@126.com；冯大领，博士，副教授，主要从事植物遗传育种及利用等工作，E-mail：bjdalingfeng@163.com。

常用功能

更新日期/Last Update: 2018-12-05