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[1]龙凌云,毛立彦,黄寿辉,等.蓝莓FLC基因电子克隆及生物信息学分析[J].江苏农业科学,2018,46(07):27-32.
　Long Lingyun,et al.Silico cloning and bioinformatics analysis of FLC gene in blueberry[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(07):27-32.
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蓝莓FLC基因电子克隆及生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第46卷
期数:
2018年07期
页码:
27-32
栏目:
生物技术
出版日期:
2018-04-05

文章信息/Info

Title:
Silico cloning and bioinformatics analysis of FLC gene in blueberry
作者:
龙凌云;  毛立彦;  黄寿辉;  檀小辉;  於艳萍;  郝小玲;  庞新华
广西壮族自治区亚热带作物研究所，广西南宁 530001
Author(s):
Long Lingyun; et al
关键词:
蓝莓; FLC基因; 电子克隆; 生物信息学
Keywords:
-
分类号:
Q785；S663.901
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
FLC基因是MADS-box家族的重要成员，参与调控植物花芽分化和开花过程，在春化作用中起关键作用。以拟南芥(Arabidopsis thaliana)FLC基因编码蛋白序列(GenBank登录号：AAN04056.1)为探针，运用电子克隆方法获得蓝莓(Vaccinium spp.)FLC基因(VaFLC)cDNA序列，对其编码蛋白的理化性质、亲/疏水性、保守序列、二级结构和三级结构特点进行预测分析，并对该编码蛋白与其他植物中FLC基因编码蛋白的相似性和进化关系进行研究。结果表明，蓝莓FLC基因cDNA全长1 303 bp，包含1个长度为753 bp的完整开放阅读框，编码250个氨基酸，编码蛋白含有MEF2-like MADS域、I域、K域和C域4个明显的结构域，属于MADS-box基因家族中植物Ⅱ型(MIKC型)基因。在蓝莓FLC基因编码VaFLC蛋白与其他植物FLC蛋白的相似性方面，除与大豆的相似性为38%之外，与其他植物的相似性均高于40%，其中与葡萄、柑橘具有47%的相似性，与拟南芥、可可树、白桦具有46%的相似性，与梨树具有45%的相似性。蓝莓VaFLC蛋白在系统进化树上归为木本植物分支，并形成独立的小分支，推测该基因及其编码蛋白在植物FLC进化过程中保留了部分原始特征。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2016-11-05
基金项目：广西亚热带作物研究所基本科研业务费专项资金(编号：桂热研201507)；广西科技厅科技计划(编号：桂科攻1598006-1-1B)。
作者简介：龙凌云(1985—)，男，广西融安人，硕士，助理研究员，主要从事小浆果果树逆境生理生化与分子生物学方面的研究。E-mail：longyiyun851123@163.com。
通信作者：庞新华，硕士，高级农艺师，主要从事热带亚热带作物栽培与育种方面的研究工作。Tel：(0771)2539056；E-mail：gscri@126.com。
更新日期/Last Update: 2018-04-05