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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第46卷

期数:

2018年第16期

页码:

35-39

栏目:

生物技术

出版日期:

2018-08-30

文章信息/Info

Title:

Molecular identification of rice Ds-tagged dwarf mutant

作者:

郭妍妍;  赵丁丁;  孙丙耀

苏州大学医学部基础医学与生物科学学院，江苏苏州 215123

Author(s):

Guo Yanyan; et al

关键词:

Ac/Ds; TAIL-PCR; 假拟氧化还原酶蛋白; 转座足迹; GA

Keywords:

-

分类号:

S511.01

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

通过已构建的水稻Ac/Ds突变体系，研究分析新型水稻功能基因，为水稻功能基因组学提供分子遗传方面的资源。从构建的水稻Ac/Ds突变体系中，筛选得到性状稳定的矮秆突变体(mutant type，MT)和正常株高回复体(revertant type，RT)。采用热不对称交错PCR(thermal asymmetric interlaced PCR，简称TAIL-PCR)技术，克隆Ds插入的侧翼序列，对该侧翼序列进行NCBI-Blast在线比对，寻找Ds插入基因；同时利用FGENESH、GeneMark.hmm、DNAMAN、SWISS-MODEL等软件分析Ds插入基因的结构和功能。发现Ds插入在水稻第3号染色体上的OSJNBa0054H04.28基因第4外显子上，此基因编码假拟氧化还原酶蛋白(putative oxidoreductase)，该蛋白含有1个保守的2OG-Fe(Ⅱ)加氧酶蛋白结构域。同时发现，RT中有Ds发生转座，并留下8个碱基的切离足迹，其转座机制属于“内切酶模式”。后续分析发现，该基因编码的假拟氧化还原酶蛋白可能在GA的合成过程中起重要作用。此基因是一个新的株高控制基因，可能通过编码假拟氧化还原酶蛋白影响GA的合成，从而对水稻株高的维持起到重要作用。

Abstract:

-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2017-02-22
基金项目：江苏省苏州市应用基础研究计划(农业部分)(编号：SYN201204)。
作者简介：郭妍妍(1991—)，女，河南洛阳人，硕士，主要从事植物结构与发育生物学研究。E-mail：guoyanyan3@163.com。
通信作者：孙丙耀，博士，副教授，主要从事植物分子遗传学研究。Tel：(0512)65882833；E-mail：sunbingyao@suda.edu.cn。

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更新日期/Last Update: 2018-08-20