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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第48卷

期数:

2020年第14期

页码:

65-77

栏目:

生物技术

出版日期:

2020-07-20

文章信息/Info

Title:

Bioinformatics analysis of AP2 gene family in Arachis duranensis

作者:

王玲¹; 2;  刘晓伟¹; 2;  江纳³;  付春¹; 2

1.乐山师范学院竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室，四川乐山 614000；2.乐山师范学院生命科学学院，四川乐山 614000；
3.乐山师范学院数学与信息科学学院，四川乐山 614000

Author(s):

Wang Ling; et al

关键词:

蔓花生; AP2基因; 基因家族; 生物信息学

Keywords:

-

分类号:

S541⁺.901

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

AP2作为一类植物转录因子，在花的发育和营养器官的形成过程中都起着非常重要的作用。旨在对蔓花生(Arachis duranensis)AP2蛋白的理化性质及分子进化关系等进行详细的生物信息学分析。结果表明，蔓花生AP2基因家族成员编码蛋白亚细胞定位预测均在细胞核中，有11个成员的理论等电点小于7，推测该家族蛋白多为酸性蛋白，有8个成员存在2个保守结构域；该家族成员均无信号肽；除了Aradu.SE6Q0与Aradu.42K79成员中存在跨膜现象外，其他成员鲜少出现跨膜现象。亲疏水性预测结果表明，蔓花生AP2基因家族编码蛋白的亲疏水性系数均小于0，推测其为亲水蛋白；磷酸化位点主要集中在丝氨酸上；其二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。研究还得出，蔓花生AP2基因家族编码蛋白的主要保守基序是Motif1、Motif2和Motif4；Motif3、Motif4都含有YRG结构域，Motif5含有RAYD结构域；构建的系统发育树也有力地说明了AP2基因家族的进化程度。

Abstract:

-

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相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2019-09-15
基金项目：四川省科技厅项目(编号：17ZZ019)；乐山师范学院人才启动项目(编号：XJR17005)。
作者简介：王玲(1999—)，女，四川南充人，主要从事植物分子生物学研究。E-mail：1981887804@qq.com。
通信作者：付春，博士，讲师，主要从事经济植物的生物信息学研究。E-mail：fuchun421@aliyun.com。

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更新日期/Last Update: 2020-07-20