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[1]杨艳北,许晶,李袁飞,等.沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2021,49(6):40-45.
　Yang Yanbei,et al.Bioinformatics analysis of LuxR family transcriptional regulator in Rhodopseudomonas palustris[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(6):40-45.
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沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第49卷
期数:
2021年第6期
页码:
40-45
栏目:
生物技术
出版日期:
2021-03-20

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of LuxR family transcriptional regulator in Rhodopseudomonas palustris
作者:
杨艳北1; 许晶2; 李袁飞1; 贡继尚1; 饶友生1
1.南昌师范学院生物技术研究所/江西省地方鸡种遗传改良重点实验室，江西南昌 330000； 2.南昌师范学院生物系，江西南昌 330000
Author(s):
Yang Yanbei; et al
关键词:
沼泽红假单胞菌; LuxR; 生物信息学; 生物被膜
Keywords:
-
分类号:
S188
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统，从而影响细菌生物被膜的形成。利用在线生物信息学预测软件，分析LuxR家族调控蛋白序列，对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构域和功能结构域进行分析和预测，为后续研究生物被膜形成机制奠定基础，也为生物被膜增强剂的开发提供新的思路。结果表明：LuxR家族调控蛋白为不稳定的亲水性蛋白；定位在细菌的细胞质中；无信号肽结构，推断其为非分泌性蛋白；二级结构中含有α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲等结构元件；α-螺旋和无规则卷曲对三级结构的稳定和功能发挥具有重要意义；含有5个磷酸化位点，其中丝氨酸磷酸化位点包括第79位、第165位和第171位氨基酸，其中苏氨酸磷酸化位点包括第90位和第211位氨基酸；无跨膜结构域，推测LuxR家族调控蛋白不属于跨膜蛋白；LuxR家族调控蛋白参与细菌群体感应系统，含有2个保守结构域，分别为Autoind_bind和 HTH_LUXR，该蛋白通过这2个保守结构域起到转录调控的作用。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］Kernan C，Chow P P，Christianson R J，et al. Experimental and computational investigation of biofilm formation by Rhodopseudomonas palustris growth under two metabolic modes［J］. PLoS One，2015，10(6)：e0129354.
［2］刘蕾，刘义，李平兰. 益生菌生物被膜的研究进展［J］. 食品科学，2016，37(9)：214-219.
［3］Salas-Jara M J，Ilabaca A，Vega M，et al. Biofilm forming Lactobacillus：new challenges for the development of probiotics［J］. Microorganisms，2016，4(3)：35.
［4］郑世超，罗瑛，鲁涛. LuxR家族调控蛋白的结构及功能［J］. 生命科学，2010，22(9)：886-895.
［5］王越，李保珍，李丹，等. 富纳米硒沼泽红假单胞菌的肝保护作用研究［J］. 生物技术通讯，2018，29(3)：367-371.
［6］张炼辉.微生物群体感应系统的研究进展［J］. 华南农业大学学报，2019，40(5)：50-58.
［7］韩云燕，李渐鹏，于红雷，等. LuxR基因对希瓦氏菌群体感应特性的影响研究［J］. 食品科技，2019，44(3)：27-32.
［8］涂春田，汪洋，易力，等. 信号分子调控细菌生物被膜形成的分子机制［J］. 生物工程学报，2019，35(4)：558-566.
［9］Tang R，Zhu J，Feng L，et al. Characterization of LuxI/LuxR and their regulation involved in biofilm formation and stress resistance in fish spoilers Pseudomonas fluorescens［J］. International Journal of Food Microbiology，2019，297：60-71.
［10］李更森，孔晋亮，罗劲，等. 铜绿假单胞菌密度感应系统对铜绿假单胞菌-烟曲霉菌早期混合生物被膜的体外作用研究［J］. 中华医院感染学杂志，2019，29(7)：961-965，970.
［11］Zhu Y L，Hou H M，Zhang G L，et al. AHLs regulate biofilm formation and swimming motility of Hafnia alvei H4［J］. Frontiers in Microbiology，2019，10：1330.
［12］Subramoni S，Venturi V. LuxR-family ‘solos’：bachelor sensors/regulators of signalling molecules［J］. Microbiology，2009，155(5)：1377-1385.
［13］舒琴，牛永武，陈启和. 细菌生物被膜中群体感应调控机制及其控制研究展望［J］. 生物加工过程，2019，17(3)：292-299.

相似文献/References:

[1]杨艳北,许晶,马荆鄂,等.沼泽红假单胞菌相似菌株间差异功能模体的筛选和分析[J].江苏农业科学,2022,50(3):73.
　Yang Yanbei,et al.Screening and analysis of different functional motifs among similar strains of Rhodopseudomonas palustris[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(6):73.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2020-07-02
基金项目：江西省教育厅科学技术研究项目(编号：GJJ181090、GJJ202631)；南昌师范学院校级科研项目(编号：20RWYB02)；南昌师范学院博士科研启动基金(编号：NSBSJJ2018023)；国家自然科学基金(编号：31460595)；南昌师范学院“11531”工程。
作者简介：杨艳北(1986—)，男，吉林长春人，博士，讲师，主要从事蛋白质组学和生物信息学研究，E-mail：731294789@qq.com；共同第一作者：许晶(1988—)，女，河南焦作人，硕士，实验师，主要从事微生物学和生物信息学研究，E-mail：1302522503@qq.com。
通信作者：饶友生，博士，教授，主要从事遗传学研究。E-mail：rys8323571@aliyun.com。
更新日期/Last Update: 2021-03-20