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[1]闫学敏,吴英华,史艳,等.胡萝卜YUCCA基因家族鉴定及生物信息学分析[J].江苏农业科学,2021,49(23):52-57.
　Yan Xuemin,et al.Identification and bioinformatics analysis of YUCCA gene family in carrots (Daucus carota var. sativa DC.)[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(23):52-57.
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胡萝卜YUCCA基因家族鉴定及生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第49卷
期数:
2021年第23期
页码:
52-57
栏目:
生物技术
出版日期:
2021-12-05

文章信息/Info

Title:
Identification and bioinformatics analysis of YUCCA gene family in carrots (Daucus carota var. sativa DC.)
作者:
闫学敏;  吴英华;  史艳;  武喆;  侯雷平;  李梅兰
山西农业大学园艺学院，山西太谷 030801
Author(s):
Yan Xuemin; et al
关键词:
胡萝卜; 生长素; YUCCA基因家族; 生物信息学; 蛋白质结构; 染色体定位
Keywords:
-
分类号:
S631.201
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
胡萝卜是重要的根菜类蔬菜之一，根部性状影响最终的产量和品质。YUCCA基因通过介导生长素调控植物根部发育，是生长素合成途径中的关键基因。利用生物信息学方法对胡萝卜YUCCA基因家族成员进行鉴定，对其理化性质、染色体定位、系统进化树、蛋白质的二级和三级结构以及保守基序进行分析。结果表明，在胡萝卜的5条染色体上共鉴定到了14个YUCCA基因家族成员，其大部分基因含有3~4个外显子；该家族编码的蛋白质为富含碱性氨基酸的亲水性蛋白质，氨基酸数量为290~424个，其蛋白质结构主要以α-螺旋和无规则卷曲构成，通过构建系统进化树可将其分为3个亚族，且亚细胞定位结果显示，YUCCA基因家族蛋白质大部分被定位在细胞质中。这为YUCCA基因家族在调控胡萝卜根发育和膨大机制研究奠定了理论基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2021-07-16
基金项目：山西省重点研发计划重点项目子课题(编号：201703D211001-04-01)；山西省重点研发计划(编号：201903D221063)。
作者简介：闫学敏(1997—)，女，山西吕梁人，硕士研究生，主要从事蔬菜育种及生物技术应用研究。E-mail：464679520@qq.com。
通信作者：李梅兰，博士，教授，主要从事蔬菜育种及生物技术应用研究。E-mail：15935485975@163.com。
更新日期/Last Update: 2021-12-05