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[1]欧江涛,蒋启程,周刻焱,等.基于芯片筛选螺原体感染中华绒螯蟹血细胞的免疫microRNAs[J].江苏农业科学,2022,50(17):46-52.
　Ou Jiangtao,et al.Screening of immune microRNAs in Eriocheir sinensis hemocytes infected with Spiroplasma eriocheiris based on microfluidic chip[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(17):46-52.
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基于芯片筛选螺原体感染中华绒螯蟹血细胞的免疫microRNAs(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第50卷
期数:
2022年第17期
页码:
46-52
栏目:
生物技术
出版日期:
2022-09-05

文章信息/Info

Title:
Screening of immune microRNAs in Eriocheir sinensis hemocytes infected with Spiroplasma eriocheiris based on microfluidic chip
作者:
欧江涛; 蒋启程; 周刻焱; 柳巧; 栾筱琪; 王资生; 张启焕
盐城工学院海洋与生物工程学院，江苏盐城 224051
Author(s):
Ou Jiangtao; et al
关键词:
中华绒螯蟹; 螺原体; microRNA; 微流体芯片
Keywords:
-
分类号:
S917
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为筛选分析螺原体(Spiroplasma eriocheiris)感染中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)血细胞免疫相关microRNAs(miRNA)及其差异表达情况，利用微流体芯片技术，对正常和感染螺原体的中华绒螯蟹血细胞miRNA进行系统的鉴定与表达检测；结合生物信息学方法，分析其靶基因和免疫信号通路。利用前期研究和已有报道897条成熟miRNA作为探针订制单色芯片，使用Cy3染料标记，通过与中华绒螯蟹血细胞总RNA样本杂交，鉴定miRNA，检测其表达情况；对差异表达的miRNA进行靶基因预测、功能聚类和通路分析；随机挑选部分差异表达的miRNA进行茎环RT-qPCR验证。结果显示，总共鉴定出中华绒螯蟹血细胞miRNA共303个；健康组和试验组共表达miRNA有48个；差异表达miRNA为27个，其靶基因共注释到116个GO和63个KEGG通路；通过茎环RT-qPCR检测，结果与芯片基本一致。研究发现，差异表达miRNA靶基因，许多均存在于重要免疫信号通路之中，研究结果可为进一步分析中华绒螯蟹血细胞螺原体感染中的miRNA与其靶基因间的免疫调控机制提供借鉴。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2021-08-27
基金项目：国家自然科学基金面上项目(编号：31872601)。
作者简介：欧江涛(1975—)，男，贵州织金人，博士，副教授，主要从事动物生物技术研究，E-mail：ojt110@126.com；共同第一作者：蒋启程(1999—)，男，江苏南京人，主要从事动物生物技术研究，E-mail：qicheng_jiang@163.com。
通信作者：王资生，博士，教授，主要从事生物生物技术研究。E-mail：wzs399@126.com。
更新日期/Last Update: 2022-09-05