[1]崔国艳,程红兵,何鑫,等.基于16S rDNA序列的1株灭螺微生物的分子鉴定[J].江苏农业科学,2017,45(01):16-19.
　Cui Guoyan,et al.Molecular identification of a strain of molluscicidal microorganisms based on 16S rDNA sequence[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(01):16-19.
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基于16S rDNA序列的1株灭螺微生物的分子鉴定()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第45卷
期数:
2017年01期
页码:
16-19
栏目:
生物技术
出版日期:
2017-01-05

文章信息/Info

Title:
Molecular identification of a strain of molluscicidal microorganisms based on 16S rDNA sequence
作者:
崔国艳1;  程红兵1;  何鑫2;  彭交凤3;  闾丘思嘉2;  黄成铭2
1.长治医学院微生物教研室，山西长治 046000； 2.中南大学湘雅医学院病原生物教研室，湖南长沙 410078；
3.长沙金城医学检验所有限公司，湖南长沙 410078
Author(s):
Cui Guoyan; et al
关键词:
钉螺; 微生物; 16S rDNA; 系统发育树
Keywords:
-
分类号:
R383.2+4；S182
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
从湖南省汨罗市血吸虫防治基地土壤中分离得到1株灭螺活性较强的微生物菌株B59，以B59菌株的总DNA为模板，采用细菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增并测其核酸序列，得到1条约1 500 bp的片段。通过Blast软件在GenBank中进行同源性检索，将其与同源性较高的菌株的ITS序列进行ClustalX序列差异和同源性分析，分别使用MEGA 6.0软件中的邻接法、Phylip软件中的最大简约法及最大似然法构建系统发育树。结果显示，3种方法构建的系统发育树基本一致，B59菌株与Bacillus cereus的亲缘关系最近，聚为一支，相似度达100%。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］ Cui G Y，Wang S P，Cheng H B，et al. Screening of microorganisms against Oncomelania hupensis and assessing the molluscicidal efficacy［J］. Microbiology China，2015，42(6)：1060-1066.
［2］Dai J R，Li Y Z，Wang F，et al. Sensitivity of Oncomelania hupensis to niclosamidea nation-wide survey in China［J］. International Journal of Environmental Research，2014，11(3)：3086-3096.
［3］Manus D P，Gray D J，Li Y S，et al. Schistosomiasis in the People’s Republic of China：the era of the three gorges dam［J］. Clinical Microbiology Review，2010，23(2)：442-466.
［4］McManus D P，Gray D J，Ross A G，et al. Schistosomiasis research in the dongting lake region and its impact on local and national treatment and control in China［J］. PLoS Neglected Tropical Diseases，2011，5(8)：e1053.
［5］李石柱，郑浩，高婧，等. 2012年全国血吸虫病疫情通报［J］. 中国血吸虫病防治杂志，2013，25(6)：557-563.
［6］Zhou X N，Bergquist R，Leonardo L，et al. Schistosomiasis japonica：control and research need［J］. Advance in Parasitology，2010，72：145-178.
［7］Yang F，Long E，Wen J H，et al. Linalool，derived from Cinnamomum camphora (L.) Presl leaf extracts，possesses molluscicidal activity against Oncomelania hupensis and inhibits infection of Schistosoma japonicum［J］. Parasites & Vectors，2014，7(1)：1-13.
［8］Guo D Z，Chen J，Liu Y D，et al. A high-performance molluscicidal ingredientagainstOncomelania hupensis produced by a rhizospheric strain from Phytolacca acinosa Roxb［J］. Pharmacognosy Magazine，2011，7(28)：277-283.
［9］Rottava I，Toniazzo G，Cortina P F，et al. Screening of microorganisms for bioconversion of (-)β-pinene and R-(+)-limonene to α-terpineol［J］. Lebensmittel-Wissenschaft und-Technologie，2010，43(7)：1128-1131. ［10］崔国艳，汪世平，程红兵，等. 灭钉螺微生物的筛选及功效研究［J］. 中国人兽共患病学报，2015，31(2)：109-112.
［11］Tamura K，Peterson D，Peterson N，et al. MEGA5：molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood，evolutionary distance，and maximum parsimony methods［J］. Molecular Biology and Evolution，2011，28(10)：2731-2739.
［12］曾静，窦岳坦，王磊，等. 新疆地区盐湖的中度嗜盐菌16S rDNA全序列及DNA同源性分析［J］. 微生物学报，2002，42(2)：133-137.
［13］李琬，李璐，李景鹏，等. 三株田间分离大豆根瘤菌16S rDNA基因鉴定及序列比较［J］. 东北农业大学学报，2007，38(6)：725-728.
［14］Hugenholtz P，Huber T. Chimeric 16S rDNA sequences of diverse origin are accumulating in the public databases［J］. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology，2003，53(1)：289-293.
［15］殷婷婷，薛梦颖，丁丽燕，等. 嗜盐细菌XJ12的分子鉴定与生长特性研究［J］. 江苏农业科学，2013，41(11)：368-370.
［16］Sridhar S，Lam F，Blelloh G E，et al. Direct maximum parsimony phylogeny reconstruction from genotype data［J］. BMC Bioinformatics，2007，8(1)：472-486.
［17］Foulds L R，Graham R L. The Steiner problem in phylogeny is NP-complete［J］. Advances in Applied Mathematics，1982，3(1)：43-49.
［18］张丽娜，荣昌鹤，何远，等. 常用系统发育树构建算法和软件鸟瞰［J］. 动物学研究，2013，34(6)：640-650.
［19］郭青云，郭道义，李永东，等. 几种杀螺细菌的筛选与功效研究［J］. 生物学杂志，2009，26(2)：31-34.
［20］Ramarao N，Sanchis V. The pore-forming haemolysins of Bacillus cereus：a review［J］. Toxins，2013，5(6)：1119-1139.
［21］Reis A L S，Montanhini M，Bittencourt J V M，et al. Gene detection and toxin production evaluation of hemolysin BL of Bacillus cereus isolated from milk and dairy products marketed in Brazil［J］. Brazilian Journal of Microbiology，2013，44(4)：1195-1198.
［22］Hamdache A，Lamarti A，Aleu J，et al. Non-peptide metabolites from the genus Bacillus［J］. Journal of Natural Products，2011，74(4)：893-899.

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2015-11-23
基金项目：国家自然科学基金 (编号：81271862)；国家科技支撑计划 (编号：2009BAI78B05)。
作者简介：崔国艳(1980—)，女，山西长治人，硕士，副教授，主要从事病原微生物活性物质研究。E-mail：cuigy2212@163.com。
更新日期/Last Update: 2017-01-05