[1]毛立彦,龙凌云,谢振兴,等.中国莲P1B -ATPase亚家族成员的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2018,46(22):48-55.
　Mao Liyan,et al.Bioinformatics analysis of P1B-ATPase subfamily in Nelumbo nucifera[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(22):48-55.
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中国莲P1B -ATPase亚家族成员的生物信息学分析()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第46卷
期数:
2018年第22期
页码:
48-55
栏目:
生物技术
出版日期:
2018-12-01

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of P1B-ATPase subfamily in Nelumbo nucifera
作者:
毛立彦;  龙凌云;  谢振兴;  於艳萍;  丁丽琼;  黄秋伟;  宾振钧;  金刚
广西壮族自治区亚热带作物研究所，广西南宁 530001
Author(s):
Mao Liyan; et al
关键词:
中国莲; 基因组; P1B-ATPase; 重金属; 生物信息学
Keywords:
-
分类号:
Q78；S682.320.1
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
P1B-ATPase是在生物中广泛存在的一类可通过水解ATP跨膜运送重金属离子的蛋白，属于P型ATPase家族的一个亚类，在植物对重金属离子的转运过程中扮演着重要角色。以拟南芥和水稻中已知的P1B-ATPase蛋白为对照，对中国莲P1B-ATPase蛋白亚家族成员进行序列比对、系统发育、保守基序、跨膜结构、二级结构、三级结构和亚细胞定位等生物信息学分析。结果表明，中国莲存在4个P1B-ATPase蛋白，分别命名为NnHMA1、NnHMA2、NnHMA3、NnHMA4，其中NnHMA1属于Zn2+/Co2+/Cd2+/Pb2+P1B-ATPase(Zn亚类)，NnHMA2、NnHMA3、NnHMA4属于Cu+/Ag+P1B-ATPase(Cu亚类)，它们均定位于质膜上，属于跨膜蛋白，有5～8个跨膜结构，含有DKTGT、TGE、C/SPx、HP等保守基序；二级结构和三级结构在组成和结构上具有较高的相似性和保守性，以α-螺旋、无规卷曲元件为主，其他元件包括延伸链和β-转角等。研究结果展示了中国莲P1B-ATPase蛋白亚家族成员的序列基本信息和结构特点，为深入研究中国莲P1B-ATPase蛋白及其编码基因的功能提供了理论基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2017-11-28
基金项目：广西自然科学基金(编号：2016GXNSFAA380093)；广西壮族自治区亚热带作物研究所基本科研业务费专项资金(编号：桂热研201602)。
作者简介：毛立彦(1988—)，女，陕西汉中人，硕士，助理研究员，研究方向为园林植物分子育种。E-mail：maoliyan215@163.com。
通信作者：金刚，博士，高级实验师，研究方向为植物分子生物学。Tel：(0771)2539056；E-mail：jing8118@163.com。
更新日期/Last Update: 2018-11-20