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[1]王乙淋,李宏宇,韦共宇,等.基于转录组和代谢组分析八角黄酮类化合物合成途径关键基因[J].江苏农业科学,2024,52(12):60-68.
 Wang Yilin,et al.Study on key genes of flavonoid biosynthesis pathway in Illicium verum based on transcriptome and metabolome[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2024,52(12):60-68.
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基于转录组和代谢组分析八角黄酮类化合物合成途径关键基因(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第52卷
期数:
2024年第12期
页码:
60-68
栏目:
生物技术
出版日期:
2024-06-20

文章信息/Info

Title:
Study on key genes of flavonoid biosynthesis pathway in Illicium verum based on transcriptome and metabolome
作者:
王乙淋1李宏宇1韦共宇1蒙泳成1黄勇123
1.广西中医药大学,广西南宁 530200; 2.广西壮瑶药重点实验室,广西南宁 530200; 3.广西高校中药民族药资源保护与利用重点实验室,广西南宁 530200
Author(s):
Wang Yilinet al
关键词:
八角转录组代谢组黄酮类关键基因
Keywords:
-
分类号:
R282.71;R284.3
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为解析八角(Illicium verum Hook.f)黄酮类成分合成途径的关键基因,以八角果实和叶片为试验材料,进行转录组测序分析和UPLC-ESI-MS/MS代谢组分析,并将两组学进行联合分析。八角代谢组分析获得12类共1 292种化合物,不同组织次生代谢产物的累积有明显的差异,共有571个差异代谢物(DAMs),包括331个上调基因、240个下调基因,其中黄酮类化合物占比最大;测序共获得41.04 Gb的clean data,各样本Q30碱基占91.37%及以上。八角果和叶中检测并筛选得到4 506个差异基因(DEGs),包括2 035个上调基因、2 471个下调基因,其中有132个与黄酮合成相关的差异基因;两组学联合分析筛选得到25个代谢物和33个基因,将其进行相关性分析发现,C4H、CHS、CHI、F3H、F3′H、F3′5′H等基因的表达水平与黄酮代谢物的积累显著相关,表明这些基因参与调控黄酮类化合物的生物合成。本研究首次阐释了八角黄酮类成分的合成途径和相关基因,为利用生物工程技术生产其黄酮类化合物提供了依据,对于扩大用药资源具有重要意义。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2023-08-02
基金项目:广西自然科学基金(编号:2020GXNSFAA238017、2023GXNSFDA026065、2019GXNSFAA245084);广西壮瑶药重点实验室项目(编号:GXZYKF2022-20);广西中医药大学研究生教育创新计划(编号:YCSY2023006);广西研究生联合培养基地项目(编号:桂学位〔2021〕6号);广西高校大学生创新创业训练计划(编号:S202210600060、S202210600063)。
作者简介:王乙淋(1999—),女,广西河池人,硕士研究生,主要从事中药(壮瑶药)鉴定研究。E-mail:2460228324@qq.com。
通信作者:黄勇,博士,教授,主要从事中药资源和分子生药研究。E-mail:huangykiz@163.com。
更新日期/Last Update: 2024-06-20