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[1]霍如雪,刘振宁,杨青,等.桃PME基因家族的鉴定与分析[J].江苏农业科学,2016,44(05):24-30.
　Huo Ruxue,et al.Identification and analysis of PME gene family in peach[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(05):24-30.
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桃PME基因家族的鉴定与分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第44卷
期数:
2016年05期
页码:
24-30
栏目:
生物技术
出版日期:
2016-05-25

文章信息/Info

Title:
Identification and analysis of PME gene family in peach
作者:
霍如雪1;  刘振宁2;  杨青1;  王光全1
1.聊城大学生命科学学院，山东聊城 252000；2.浙江大学农业与生物技术学院，浙江杭州 310058
Author(s):
Huo Ruxue; et al
关键词:
桃; 果胶甲酯酶; 基因家族; 生物信息学
Keywords:
-
分类号:
S662.101
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
果胶甲酯酶属于碳水化合物酯酶家族CE-8，是调节果胶甲酯化程度的一种普遍存在的酶，是植物细胞壁的主要成分。为深入研究桃PME基因家族的功能，利用生物信息学方法对桃基因组中PME基因家族成员进行鉴定，并对其基因组信息、蛋白生理生化特征、基因结构、保守结构域和系统进化树等方面进行了研究。结果表明：在桃基因组中共鉴定出69个PME基因，可以分为Group Ⅰ、Group Ⅱ两大类，Group Ⅱ又可以进一步分成3个分支；PME基因在桃的8条染色体上呈现不均匀分布，并存在明显的串联重复现象，共发现18个串联重复基因簇，包含47个基因，串联重复是桃PME基因扩增的主要方式。对桃PME基因结构的分析表明，PME基因在进化上存在着一定的保守性；对桃PME蛋白氨基酸序列的多重比对发现了PME蛋白5个典型的保守结构区域；通过MEME软件对桃PME蛋白保守基序的分析发现了12个比较保守的基序。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2016-02-16
基金项目：山东省科技攻关项目(编号：2009GG10031)。
作者简介：霍如雪(1988—)，女，山东临沂人，硕士研究生，主要从事系统与资源植物学研究。E-mail：huoruxue@126.com。
通信作者：王光全，教授，从事果树学研究。E-mail：wgq@lcu.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2016-05-25