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[1]张丹,颜梦秋,张美彦,等.香菇微卫星标记变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的应用及正交优化[J].江苏农业科学,2021,49(5):57-61.
 Zhang Dan,et al.Application and orthogonal optimization of denaturing polyacrylamide gel electrophoresis with microsatellite labeling of Lentinus edodes[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(5):57-61.
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香菇微卫星标记变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的应用及正交优化(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第49卷
期数:
2021年第5期
页码:
57-61
栏目:
生物技术
出版日期:
2021-03-05

文章信息/Info

Title:
Application and orthogonal optimization of denaturing polyacrylamide gel electrophoresis with microsatellite labeling of Lentinus edodes
作者:
张丹颜梦秋张美彦谭琦宋春艳尚晓冬
上海市农业科学院食用菌研究所/农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室/
国家食用菌工程技术研究中心/上海市农业遗传育种重点实验室,上海 201403
Author(s):
Zhang Danet al
关键词:
香菇变性聚丙烯酰胺凝胶电泳微卫星标记正交试验设计银染试验
Keywords:
-
分类号:
S646.1+20.1
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
变性聚丙烯酰胺凝胶电泳是一种高效鉴定微卫星分子标记的方法,广泛应用于种质鉴定、遗传连锁图谱构建及分子标记辅助育种等研究中。该方法由于操作繁琐,目前在食用菌领域的应用尚不广泛。以香菇为研究对象,建立变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的检测流程,并利用正交试验对检测流程中涉及的加样缓冲液与PCR反应液的体积比、95 ℃变性时间、置于冰上冷却时间、银染时间、银染后胶板去离子水洗时间等5个操作节点进行优化。结果表明,加样缓冲液与PCR反应液体积比为1∶2,95 ℃变性2~5 min,置于冰上冷却15~20 min,银染7 min,银染后胶板用去离子水洗5~10 s是正交试验的较优处理组合。试验建立了香菇微卫星标记变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测操作规程,该操作规程具有成本低、效率高、易批量化操作等优点,对其他食用菌微卫星标记的应用具有重要的参考价值。
Abstract:
-

参考文献/References:

[1]洪彦彬,梁炫强,陈小平,等. 花生栽培种SSR遗传图谱的构建[J]. 作物学报,2009,35(3):395-402.
[2]匡猛,杨伟华,许红霞,等. 中国棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及SSR标记遗传多样性分析[J]. 中国农业科学,2011,44(1):20-27.
[3]邢冰,董诚明,魏硕,等. 怀菊转录组中SSR位点信息分析[J]. 江苏农业科学,2020,48(11):57-60.
[4]曲鲁江,李显耀,杜志强,等. 微卫星PCR产物变性与非变性PAGE-银染检测方法的比较[J]. 遗传,2004,26(4):522-524.
[5]张春雷,佟广香,匡友谊,等. 微卫星产物变性与非变性PAGE-银染方法比较[J]. 水产学杂志,2010,23(1):11-14.
[6]巫萍,章炉军,张丹,等. 利用SSR标记鉴定香菇单核体及杂交后代[J]. 微生物学通报,2016,43(2):444-455.
[7]肖扬,李黎,吴茜,等. 香菇SSR-PCR技术体系的优化及其在遗传多样性分析中的初步应用[J]. 中国农学通报,2009,25(2):20-24.
[8]叶翔,黄晨阳,陈强,等. 中国主栽香菇品种SSR指纹图谱的构建[J]. 植物遗传资源学报,2012,13(6):1067-1072.
[9]张丹,巫萍,章炉军,等. 基于香菇全基因组序列开发的部分SSR标记多态性分析与品种鉴定初探[J]. 食用菌学报,2012,19(4):1-10.
[10]Kuhad R C,Kapoor R K,Lal R. Improving the yield and quality of DNA isolated from white-rot fungi[J]. Folia Microbiologica,2004,49(2):112-116.
[11]杨亚桐,董安忆,刘松涛,等. 基于SSR分子标记的糯玉米遗传多样性研究[J]. 江苏农业科学,2020,48(2):83-86.
[12]李建武,李宁. SSR标记变性聚丙烯酰胺凝胶快速银染方法的建立[J]. 中国马铃薯,2015,29(3):136-140.
[13]王爱听,李永生,穆延召,等. 玉米微卫星PCR产物变性与非变性PAGE-银染法的比较分析[J]. 玉米科学,2013,21(3):48-51.
[14]李立群,王培,王小利,等. SSR标记变性聚丙烯酰胺凝胶电泳方法改进[J]. 安徽农业科学,2012,40(34):16541-16544.
[15]王伟,杨文鹏,关琦,等. 玉米SSR分子标记技术操作规程的优化[J]. 安徽农业科学,2008,36(11):4459-4464,4493.

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2020-07-18
基金项目:上海市食用菌产业技术体系建设专项资金[编号:沪农科产字(2019)第9-03号];现代农业产业技术体系建设专项资金(编号:CARS-20)。
作者简介:张丹(1986—),男,江苏泗洪人,硕士,助理研究员,从事食用菌育种研究。E-mail:zdfungi@126.com。
通信作者:尚晓冬,博士,研究员,从事食用菌遗传育种研究。E-mail:xdshang@163.com。
更新日期/Last Update: 2021-03-05