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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第53卷

期数:

2025年第6期

页码:

33-47

栏目:

生物技术

出版日期:

2025-03-20

文章信息/Info

Title:

Genome-wide association analysis of foxtail millet traits at heading stage based on 96K SNP chip

作者:

王钰文¹; 钟鑫¹; 范晓庆¹; 刘颖慧¹; 赵治海²; 范光宇²; 王晓明²

1.河北北方学院农林科技学院，河北张家口 075000； 2.张家口市农业科学院谷子研究所，河北张家口 075000

Author(s):

Wang Yuwen; et al

关键词:

谷子; 全基因组关联分析; SNP; 抽穗期性状; 候选基因

Keywords:

-

分类号:

S188；S515.01

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

抽穗期是衡量农作物重要性的一个关键指标，它直接影响作物对地区和季节的适应能力。了解不同谷子品种的适宜种植区域，对于农业生产和实践具有极其重要的意义。为揭示控制抽穗期性状的遗传机制，为开展理想性状标记辅助选择育种奠定基础，调查了230个样本的抽穗期叶姿、刚毛长度、刚毛颜色、护颖颜色、花药颜色、茎秆长度、茎秆粗度、伸长节间数8个抽穗期性状并进行基因组重测序，拟以水稻抽穗期相关性状为研究对象，利用R软件中GWASpoly方法对水稻抽穗前后的相关性状进行多层次的相关性研究，利用基于1-随机和正双(种群结构+血缘)的杂交 Q+K (种群结构+血缘)方法，分别构建分位数-分位数(QQ-Plot)和曼哈顿图。筛选与表型相关性显著的 单核苷酸多态性位点(SNPs)，在10 kb区间找到与表型相关的基因，并对这些SNPs进行功能注释。明确了每个性状与其具有显著关联性的染色体位置以及关联度，与抽穗期叶姿、刚毛长度、刚毛颜色、护颖颜色、花药颜色、茎秆长度、茎秆粗度、伸长节节间数关联的SNP的关键位点在9条染色体上均有分布。

Abstract:

-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2024-04-08
基金项目：国家现代农业产业技术体系建设专项(编号：CARS-06-14.5-A7)；河北省重点研发计划(编号：21326302D)；河北北方学院校级课题；河北宣化谷子科技小院项目。
作者简介：王钰文(1998—)，男，山东潍坊人，硕士研究生，研究方向为作物栽培，E-mail：929660014@qq.com；共同第一作者：钟鑫(1997—)，女，河北承德人，硕士研究生，研究方向为分子植物育种，E-mail：1815708558@qq.com。
通信作者：刘颖慧，博士，教授，研究方向为作物栽培。E-mail：leely519@126.com。

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更新日期/Last Update: 2025-03-20