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[1]鲍思元.水稻PLA-I{gamma}1类似基因的电子克隆及生物信息学分析[J].江苏农业科学,2014,42(05):23-29.
　Bao Siyuan.In silico cloning and bioinformatics analysis of PLA-I{gamma}1-like gene from rice[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(05):23-29.
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水稻PLA-I{gamma}1类似基因的电子克隆
及生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第42卷
期数:
2014年05期
页码:
23-29
栏目:
生物技术
出版日期:
2014-05-25

文章信息/Info

Title:
In silico cloning and bioinformatics analysis of PLA-I{gamma}1-like gene from rice
作者:
鲍思元
湖北科技学院基础医学院，湖北咸宁 437100
Author(s):
Bao Siyuan
关键词:
水稻; 脂肪酶; 生物信息学; 氨基酸序列
Keywords:
-
分类号:
A
DOI:
-
文献标志码:
Q943.2；S511.03
摘要:
利用NCBI数据库及电子克隆技术克隆了水稻PLA-I{gamma}1类似基因，命名为OsPLA-I{gamma}1。序列分析表明，其开放阅读框为1 374 bp，只含有1个外显子，没有内含子。利用生物信息学软件对OsPLA-I{gamma}1蛋白的理化性质、疏水性/亲水性、跨膜区、亚细胞定位、蛋白质结构及功能等进行预测分析。结果表明：该蛋白分子式为C2138H3409N625O637S19，氨基酸总数为457个，分子量为48 670.5，理论等电点为pI 8.86，为亲水性稳定蛋白；α螺旋和不规则卷曲是其蛋白质二级结构的主要构件，延伸链散布于整个蛋白质中；属于脂肪酶，活性受可逆磷酸化或糖基化作用调控，具有能量代谢功能，是水稻的生长因子；定位于叶绿体基质腔中；含有19个蛋白激酶磷酸化位点，“Ser”磷酸化位点11个，“Thr”磷酸化位点5个，“Tyr”磷酸化位点3个；含有17个“O-β-GlcNAc”位点，丝氨酸5个，苏氨酸12个；与粗山羊草、蒺藜苜蓿、甘蓝型油菜、拟南芥的脂肪酶有较高的同源性。本研究结果为进一步研究该基因的功能和作用机制奠定基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2013-08-26
基金项目：湖北科技学院科研课题（编号：SK0612）。
作者简介：鲍思元(1976—)，男，湖北麻城人，硕士，讲师，研究方向为植物分子遗传学和生物技术。E-mail：baosyuan@163.com。
更新日期/Last Update: 2014-05-25