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[1]葛辰,凌去非,李彩娟,等.基于第二代测序的大鳞副泥鳅生长相关SNP标记的开发[J].江苏农业科学,2014,42(10):21-27.
　Ge Chen,et al.Development of growth-associated SNP markers of Paramisgurnus dabryanus based on next-generation sequencing[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(10):21-27.
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基于第二代测序的大鳞副泥鳅生长相关SNP标记的开发(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第42卷
期数:
2014年10期
页码:
21-27
栏目:
生物技术
出版日期:
2014-10-25

文章信息/Info

Title:
Development of growth-associated SNP markers of Paramisgurnus dabryanus based on next-generation sequencing
作者:
葛辰;  凌去非;  李彩娟;  叶竹青;  韩晓飞;  王国成;  朱鹏飞
苏州大学医学部基础医学与生物科学学院，江苏苏州 215123
Author(s):
Ge Chen; et al
关键词:
大鳞副泥鳅; 高通量测序; SNP; 多态性标记; 引物设计
Keywords:
-
分类号:
S917.4
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
大鳞副泥鳅是鳅科重要经济鱼类，通过Illumina HiSeq 2000测序平台对2个大鳞副泥鳅样本的转录本进行了高通量测序，其中AB2011M-1是群体中生长较快的10尾鱼的混合转录本，AB2011M-2是生长较慢的10尾鱼的混合转录本。通过对以上2个混合转录本的测序，分别获得了65 536和80 786个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，SNP)突变；对2个测序样本进行表达差异的比较，获得了39个表达差异基因。随机选取120个位点设计引物，进行验证分析，共获得16个有效的多态性标记。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2013-12-24
基金项目：江苏省农业科技自主创新资金［编号：CX(13)2042］；江苏省科技支撑计划(编号：BE2012354)；江苏省水产三项工程(编号：PJ2011-62)。
作者简介：葛辰(1989—)，男，江苏苏州人，硕士研究生，主要从事水生动物种质资源保护与利用研究。E-mail：sishen0129@163.com。
通信作者：凌去非，博士，副教授，主要从事鱼类遗传育种与保护生物学研究。E-mail：lingqf@suda.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2014-10-25