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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第48卷

期数:

2020年第04期

页码:

65-72

栏目:

生物技术

出版日期:

2020-03-25

文章信息/Info

Title:

Bioinformatics analysis of sixteen microbial proteases

作者:

富玉竹;  李欣;  李晔;  王斯德;  金丽华;  于然

北京电子科技职业学院生物工程学院，北京 100176

Author(s):

Fu Yuzhu; et al

关键词:

微生物; 蛋白酶; 序列分析; 生物信息学; 理化性质; 蛋白结构; 信号肽

Keywords:

-

分类号:

S188⁺.3

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

蛋白酶(protease)是以降解蛋白质为主的糖苷酶，具有丰富的多样性，在生物有机体中发挥着重要而又广泛的作用，具有广泛的研究和应用价值。本研究采用ProtParam、ProtScale、SignalP 4.1 server和NPSA serve等生物信息学软件，对天蓝色链霉菌、普通拟杆菌、金黄色葡萄球菌、枯草杆菌等16种微生物蛋白酶的理化性质、蛋白结构、系统发生树和功能域等进行了分析。结果表明：通过分析16种微生物蛋白酶的稳定性发现，金黄色葡萄球菌、唾液链球菌、短小芽孢杆菌、绿脓杆菌为不稳定蛋白；二级结构由α螺旋、β转角、无规则卷曲和延伸链等结构元件组成；除了节杆菌属、无乳链霉菌、普通拟杆菌、肠杆菌属具有信号肽，其余蛋白酶氨基酸序列不具有信号肽的特点。可以推测出蛋白酶为非分泌性蛋白；只有绿脓杆菌和猪链球菌有跨膜结构，剩下其余几种微生物均没有跨膜结构。具有2个蛋白功能域，分别为Peptidase S8 familyi、Fn3_5like domain。

Abstract:

-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2018-12-14
基金项目：北京市自然科学基金(编号：2182019)；北京市教育委员会项目(编号：1-PXM2018-014306-000057/7)；国家自然科学基金青年科学基金(编号：51708005)；北京电子科技职业学院重点课题(编号：2019-KXZ)；北京市优秀人才资助(拔尖自然科学)(编号：2020Z002-002-KWT)。
作者简介：富玉竹(2000—)，女，北京人，研究方向为酶与基因重组，E-mail：1002967685@qq.com；共同第一作者：李欣(1998—)，女，北京人，研究方向为生物技术，E-mail：1217436404@qq.com。
通信作者：李晔，博士，副教授，研究方向为蛋白重组表达和分子诊断。E-mail：liyeyashi@163.com。

常用功能

更新日期/Last Update: 2020-02-20