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[1]张力鹏,滕彦娇,王宏鹏,等.西藏大花红景天EST-SSR开发及通用性分析[J].江苏农业科学,2021,49(11):40-48.
　Zhang Lipeng,et al.EST-SSR development and universal analysis of Tibet Rhodiola crenulata[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(11):40-48.
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西藏大花红景天EST-SSR开发及通用性分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第49卷
期数:
2021年第11期
页码:
40-48
栏目:
生物技术
出版日期:
2021-06-05

文章信息/Info

Title:
EST-SSR development and universal analysis of Tibet Rhodiola crenulata
作者:
张力鹏; 滕彦娇; 王宏鹏; 李天宇; 宋文芹; 陈成彬
南开大学生命科学学院，天津 300071
Author(s):
Zhang Lipeng; et al
关键词:
大花红景天; 转录组; SSR; 通用性分析
Keywords:
-
分类号:
S567.23+9.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
以西藏大花红景天为研究对象，用MISA软件筛选转录组测序获得的48 790条unigene，开发EST-SSR(表达序列标签-微卫星序列)并对其通用性进行分析，以期为红景天属物种的遗传多样性研究和分子标记辅助育种奠定基础。结果表明，共检测出10 761个SSR位点，分布于8 973条unigene中，分布频率为22.06%，平均分布距离为4.725 kb。优势重复基序以单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸为主，其中单核苷酸重复单元以基序A/T为主，共7 167个，二核苷酸重复单元以AG/CT为主，共1 008个。随机合成280对引物，其中248对表现出有效扩增，54对具有多态性。此外，SSR引物在长鞭红景天、狭叶红景天、菊叶红景天、圣地红景天、柴胡红景天、高山红景天中具有较高的通用性，扩增效率分别为75.0%、73.75%、72.5%、62.5%、70.0%、72.5%。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2020-08-29
作者简介：张力鹏(1989—)，男，河北沧州人，博士，助理研究员，主要从事中药材种质资源品种改良研究。E-mail：nknanhai@163.com。
通信作者：陈成彬，博士，副教授，主要从事中药材种质资源与品种改良研究。E-mail：chencb@nankai.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2021-06-05