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[1]程欢,张东华,张俊忠,等.苹果砧木T337不同组织内生菌群落及其功能预测[J].江苏农业科学,2022,50(14):144-154.
　Cheng Huan,et al.Endophytic microbial community analysis and function prediction in different tissue parts of apple rootstock T337[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(14):144-154.
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苹果砧木T337不同组织内生菌群落及其功能预测(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第50卷
期数:
2022年第14期
页码:
144-154
栏目:
园艺与林学
出版日期:
2022-07-20

文章信息/Info

Title:
Endophytic microbial community analysis and function prediction in different tissue parts of apple rootstock T337
作者:
程欢; 张东华; 张俊忠; 刘丽
西南林业大学保护生物学学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室，云南昆明 650224
Author(s):
Cheng Huan; et al
关键词:
苹果砧木T337; 高通量测序; 内生微生物; 功能预测; α-多样性分析
Keywords:
-
分类号:
S661.104
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
应用高通量测序技术分析苹果砧木T337根部、枝部、叶部的内生菌群落并利用PICRUSt进行功能预测。从苹果砧木T337不同部位的内生细菌中共获得的有效序列聚类为11 386个操作分类单元(OTUs)。从内生真菌中获得的有效序列聚类为2 718个OTUs。α-多样性分析结果表明，各指数均为根部显著高于枝部、叶部，枝部、叶部间的差异则不显著；从内生真菌多样性上看，除辛普森(Simpson)指数表现为根部、叶部显著高于枝部外，其他指数均表现为根>叶>枝。物种丰度分析结果表明，在门水平上，T337根部的最优细菌门为放线菌门(Actinobacteria)，枝部、叶部的最优细菌门为变形菌门(Proteobacteria)；在属水平上，T337根部、枝部、叶部最具优势的内生细菌分别为变形菌门的鞘氨醇单胞属(Sphingomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)、甲基杆菌属(Methylobacterium)；根部的特有菌属最多，有187个，枝部有5个，叶部有6个。T337根部、枝部、叶部都存在大量未归类的内生细菌(占比分别为35885%、50185%、59.884%)。根、枝、叶3个部位最优势真菌门均为子囊菌门(Ascomycota)，内生真菌优势属分别为子囊菌门的亚隔孢属(Didymella)、Knufia(尚无统一的中文名)和壳针孢属(Septoria)。根部内生真菌的特有属有121个，枝部样品的特有属有7个，叶部样品的特有属有35个。根、枝、叶中也存在大量未归类的内生真菌(占比分别为41031%、82.036%、39.467%)。功能预测结果显示，苹果砧木T337内生细菌群落功能与植物组织部位发挥的功能一致，可为进一步挖掘与植物营养生长相关微生物提供参考。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2021-09-01
基金项目：国家自然科学基金(编号：31960315)；西南林业大学科研启动基金(编号：111919)。
作者简介：程欢(1995—)，女，陕西咸阳人，硕士研究生，主要从事内生微生物相关的研究。E-mail：1317723618@qq.com。
通信作者：刘丽，博士，副教授，主要从事微生物相关的研究。E-mail：cathly@126.com。
更新日期/Last Update: 2022-07-20