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[1]王兴强,卢雪旎,沈晔,等.脊尾白虾响应环境胁迫的转录组学分析[J].江苏农业科学,2022,50(3):22-27.
　Wang Xingqiang,et al.Transcriptome analysis of Exopalaemon carinicauda under environmental stress[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(3):22-27.
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脊尾白虾响应环境胁迫的转录组学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第50卷
期数:
2022年第3期
页码:
22-27
栏目:
“转录组”专题
出版日期:
2022-02-05

文章信息/Info

Title:
Transcriptome analysis of Exopalaemon carinicauda under environmental stress
作者:
王兴强1;  卢雪旎1;  沈晔1;  曹梅1;  韦寿永1;  李庆国2;  茆丹婷2;  秦传新3
1.江苏海洋大学海洋科学与水产学院，江苏连云港 222005； 2.连云港旺岛旅游开发有限公司，江苏连云港 222000；3. 中国水产科学研究院南海水产研究所，广东广州 510300
Author(s):
Wang Xingqiang; et al
关键词:
脊尾白虾; 环境胁迫; 转录组分析; 差异表达基因; 高通量测序
Keywords:
-
分类号:
S917.4
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
脊尾白虾(Palaemon carinicauda)是我国沿海滩涂混养的重要经济虾类，具有广盐、广温、抗病力和繁殖力强等优点。采用高通量测序技术对脊尾白虾转录组进行测序，对得到的转录本进行COG(clusters of orthologous groups)、GO(gene ontology)和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)分类和注释，旨在深入探讨环境胁迫(低盐、低温和溶解氧)对脊尾白虾重要相关调控基因的影响。本次测序低盐、低温和溶解氧处理组和对照组均产出>35×106条高质量序列，碱基数均>4 Gb，GC含量均>43%，Q30碱基百分比均>92%。组装得到转录本436 023条和unigene 305 682条，转录本和unigene的N50分别是814 bp和552 bp。unigene大部分(56 898条)注释到NR数据库，31 695条注释到KEGG数据库，28 919条注释到GO数据库。低温胁迫产生的差异表达基因中，具有显著性表达差异的有264条，包括上调基因215条和下调基因49条；低氧胁迫没有产生显著差异表达的基因，反观低盐胁迫有且仅有1条显著下调的基因，为α-葡糖苷酶(α-glucosidase)。低盐胁迫下α-葡萄糖苷酶表达量显著降低，可能导致脊尾白虾虾体难以维持正常的能量需求。GO富集分析发现，低温胁迫下最显著的功能节点是脂质转运活性(lipid transporter activity)和肽基二肽酶活性(peptidyl-dipeptidase activity)；而KEGG通路富集分析显示，差异表达基因显著富集到肾素-血管紧张素系统(renin-angiotensin system)中，推测低温通过抑制血管紧张素转换酶(angiotensin converting enzyme)的表达，降低了血管紧张素Ⅱ(angiotensin Ⅱ)的生成，从而降低血管平滑肌张力，抑制血压的升高和组织损伤；同时动员脂肪和蛋白质等能源物质，以响应低温胁迫。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2021-07-17
基金项目：江苏省科技厅政策引导类计划“苏北科技专项”(编号：LYG-SZ201924)；广东省渔业生态环境重点实验室开放基金(编号：FEEL_2019_3)；江苏省研究生培养创新工程研究生科研与实践创新计划(编号：SJCX20_1270)。
作者简介：王兴强(1975—)，男，山东济宁人，博士，教授，研究方向为养殖生态学。E-mail：wangxingqiang@jou.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2022-02-05