[1]赵孟良,任延靖,刘颖.PEG6000模拟干旱胁迫下菊芋HDZip基因家族的鉴定及表达分析[J].江苏农业科学,2025,53(15):37-44.
　Zhao Mengliang,et al.Identification and expression analysis of the HDZip gene family in Helianthus tuberosus under PEG6000 simulated drought stress[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2025,53(15):37-44.
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PEG6000模拟干旱胁迫下菊芋HDZip基因家族的鉴定及表达分析()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第53卷
期数:
2025年第15期
页码:
37-44
栏目:
生物技术
出版日期:
2025-08-05

文章信息/Info

Title:
Identification and expression analysis of the HDZip gene family in Helianthus tuberosus under PEG6000 simulated drought stress
作者:
赵孟良; 任延靖; 刘颖
青海大学，青海西宁 810016
Author(s):
Zhao Mengliang; et al
关键词:
菊芋; HD-Zip基因; 转录因子; 鉴定分析; 干旱胁迫
Keywords:
-
分类号:
S188；S632.901
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
通过对PEG-6000(聚乙二醇-6000)模拟干旱胁迫下的菊芋转录组数据进行分析处理，筛选出与响应干旱胁迫密切相关的HD-Zip转录因子，利用在线工具ExPASy-ProtParam tool、MEME 3.0、DNAMAN 9.0、MEGA X软件，对菊芋HD-Zip基因家族成员的蛋白质理化性质、保守基序、家族进化关系以及与模式植物拟南芥的系统进化关系进行系统分析，并采用qRT-PCR方法对干旱胁迫下菊芋叶片中HD-Zip基因家族成员的转录水平进行检测。结果表明，ExPASy-ProtParam tool分析显示，菊芋中HD-Zip基因的序列长度为330~1956 bp，平均序列长度为856 bp；能编码氨基酸的数量为109~651个，平均为284个；分子量为27 284.81~161 890.14 u，平均为70 269.39 u；等电点为4.94~5.30；HtHD-Zip基因含有保守的Motif基序的长度为15~50个碱基。进化分析结果显示，HD-Zip基因分为了六大类。qRT-PCR结果分析显示，在PEG-6000模拟干旱胁迫18 h时，HtHD-Zip4、HtHD-Zip7、HtHD-Zip17、HtHD-Zip23、HtHD-Zip25、HtHD-Zip26、HtHD-Zip30、HtHD-Zip34这8个基因明显受到干旱胁迫的诱导表达，其表达量显著上升；其中HtHD-Zip34表达量的涨幅最为显著，上升了11.9倍。研究结果表明，HtHD-Zip基因参与菊芋抵御干旱胁迫的过程。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2024-08-26
基金项目：青海省中央引导地方科技发展基金(编号：2024ZY047)；青海省昆仑英才·高端创新创业人才项目。
作者简介：赵孟良(1986—)，男，河南商丘人，博士，副教授，硕士生导师，主要从事菊芋抗逆生理及分子生物学研究。E-mail：8304269@163.com。
通信作者：任延靖，博士，副研究员，硕士生导师，主要从事作物遗传育种研究。E-mail：renyan0202@163.com。
更新日期/Last Update: 2025-08-05