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[1]陶隽,贾青,魏星灿,等.猪ACACA基因及其编码蛋白质的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2014,42(05):42-45.
　Tao Juan,et al.Bioinformatics analysis of pig ACACA gene and its encoded protein[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(05):42-45.
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猪ACACA基因及其编码蛋白质的生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第42卷
期数:
2014年05期
页码:
42-45
栏目:
生物技术
出版日期:
2014-05-25

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of pig ACACA gene and its encoded protein
作者:
陶隽1;  贾青1; 2;  魏星灿1;  胡慧艳1;  邢增喜1
1.河北农业大学动物科技学院，河北保定 071001； 2.国家北方山区农业工程技术研究中心，河北保定 071001
Author(s):
Tao Juan; et al
关键词:
猪; ACACA基因; 蛋白质; 生物信息学
Keywords:
-
分类号:
A
DOI:
-
文献标志码:
Q753
摘要:
为从分子水平研究猪脂肪合成过程，对脂肪合成关键酶乙酰辅酶A羧化酶-α基因(ACACA)进行分析。采用生物信息学的方法，查找猪ACACA基因的ORF框，对基因CDS序列的限制性酶切位点进行分析，并对其编码蛋白质的理化性质、二级结构、三级结构、拓扑结构、结构功能域进行预测分析。结果表明，猪ACACA基因CDS区全长 7 041 bp，其编码蛋白质含2 346个氨基酸。二级结构以α螺旋与无规则卷曲为主，局部出现β转角，三级结构显示结果与二级结构预测结果相符。该蛋白质为亲水性蛋白质，N端无信号肽，为非分泌蛋白质；不含跨膜结构区，未定位于膜内，预测其为膜外区蛋白质；亚细胞定位结果显示该蛋白质为非细胞器蛋白质，是胞质蛋白质的可能性最大；功能域分析发现该蛋白质序列含有BC结构域、CT结构域、CPSase 大亚基N端结构域、ATP-grasp折叠结构域、生物素基/硫辛酰基结合域等及一些蛋白质基序。该结果将为进一步研究猪ACACA基因与脂肪合成的关系提供基础资料。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2013-09-09
基金项目：河北省现代农业产业技术体系创新团队建设专项资金。
作者简介：陶隽(1989—)，女，甘肃民勤人，硕士，主要从事动物遗传学研究。E-mail：taojun0703@163.com。
通信作者：贾青，教授，博士生导师。E-mail：jiaqing@hebau.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2014-05-25