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[1]王君岩,张涵,刘哲熹,等.猪BMPR1B基因的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2023,51(1):32-44.
　Wang Junyan??et al.Bioinformatics analysis of BMPR1B gene in pig[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(1):32-44.
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猪BMPR1B基因的生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第51卷
期数:
2023年第1期
页码:
32-44
栏目:
生物技术
出版日期:
2023-01-05

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of BMPR1B gene in pig
作者:
王君岩; 张涵; 刘哲熹; 白珂瑞; 王德鹏; 吴克亮
中国农业大学动物科学技术学院动物遗传资源与分子育种实验室，北京 100193
Author(s):
Wang Junyan??et al
关键词:
猪; BMPR1B基因; 生物信息学; 选择压力; 分子共进化
Keywords:
-
分类号:
S828.2
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为了分析猪骨形态发生蛋白1B型受体BMPR1B蛋白的理化性质、高级结构、结构域、亚细胞定位、N-糖基化、同源进化关系、选择压力以及分子内共进化等，利用生物信息学软件及平台，对BMPR1B基因的结构与功能进行鉴定，为进一步探讨BMPR1B基因在母猪繁殖性状中发挥的作用奠定遗传信息基础。结果表明，猪BMPR1B基因编码502个氨基酸；相对分子量为56 960.47，理论等电点为7.78，带正电，呈碱性，不稳定，是一种跨膜的亲水蛋白；二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主，三级结构由1条主链和1条侧链构成，模型稳定，构象合理；具有3个保守的功能结构域，为激活素受体结构域、GS结构域和丝氨酸/苏氨酸激酶结构域；定位于细胞膜上，无信号肽序列，为非GPI锚定蛋白；另含有13个潜在的N-糖基化位点。系统进化分析表明：物种间，猪BMPR1B基因与马的同源性最高；物种内，猪BMPR1B基因类型上可以分为3个组，值得注意的是梅山猪作为独立的一支被分为一组，与猪的高繁殖力性状有一定联系。选择压力分析显示：猪BMPR1B基因经历了强烈的净化选择，十分保守，但在M7vs.M8模型中发现了44个强烈的正选择位点。分子共进化显示，在猪BMPR1B基因中检测到4组协同进化，涉及10个氨基酸。
Abstract:
-

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2022-03-18
基金项目：国家重点研发计划重点专项(编号：2021YFF1000603)；生猪产业技术体系北京市创新团队项目(编号：BAIC02-2021)。
作者简介：王君岩(1996—)，男，四川南充人，硕士研究生，研究方向为动物遗传资源与进化生物学。E-mail：wangjunyan_1996@cau.edu.cn。
通信作者：吴克亮，博士，教授，博士生导师，主要从事动物分子数量遗传学研究。E-mail：liangkwu@cau.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2023-01-05